Analisis Polimorfisme Gen Insulin-like Growth Factor-1 (IGF-1) pada Pertumbuhan Ayam F5 Golden Kamper (Gallus gallus domesticus)

Elysia Mutiara Azizah, Prof. Dr. Budi Setiadi Daryono, M. Agr. Sc.

2023 | Skripsi | BIOLOGI

Ayam Golden Kamper merupakan ayam hasil persilangan ayam pelung dan  ayam layer dengan produktivitas telur serta daging yang baik. Gen Insulin-like growth factor-1 (IGF-1) merupakan salah satu faktor yang mempengaruhi kecepatan pertumbuhan ayam karena berperan penting dalam pertumbuhan dan perkembangan tulang serta otot pada ayam. Penelitian ini dilakukan untuk mempelajari karakter ayam F5 Golden Kamper serta menganalisis gen IGF-1 untuk mengetahui pengaruhnya terhadap pertumbuhan ayam. Penelitian dilakukan dengan mengawinkan ayam betina dan jantan F4 Golden Kamper, pemeliharaan ayam indukan dan DOC, koleksi telur, pengambilan data fenotipik, koleksi darah, isolasi DNA, amplifikasi DNA, elektroforesis, serta sequensing. Parameter yang diamati yaitu bobot DOC selama tujuh minggu pertama, karakter fenotipik kualitatif dan kuantitatif, dan polimorfisme gen IGF-1. Analisis data dilakukan menggunakan software Microsoft Excel, Genestudio, MEGA11, dan IBM SPSS 25. Data hasil sekuensing diolah dengan aplikasi Genestudio, alignment dengan MEGA11, serta asosiasi genotipe-haplotipe menggunakan SPSS (korelasi Pearson dan uji F Regresi Linear). Hasil menunjukkan polimorfisme penanda molekuler gen IGF-1 terdapat pada 12 titik polimorfisme terjadinya mutasi. Mutasi tersebut meliputi mutasi substitusi pada 4 titik dan mutasi insersi pada 8 titik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa polimorfisme gen IGF-1 tidak memiliki korelasi dan pengaruh yang signifikan terhadap bobot ayam F5 Golden Kamper. Nilai koefisien inbreeding yang didapatkan adalah 0,375. Individu ayam F5 Golden Kamper memiliki keseragaman genetik dalam suatu populasi yang rendah.

Golden Kamper Chicken is a chicken from crossing between pelung and layer chickens that have good meat and egg productivity. Insulin-like growth factor-1 (IGF-1) gene is one of the factor that affects the speed of chicken growth because it plays an important role in the growth and development of bones and muscles in chicken. This research aim to study the character of F5 Golden Kamper chickens and to analyze the IGF-1 gene to determine its effect on chicken growth. The research will be done by hybridising F4 Golden Kamper hens and males, raising broodstock and DOC, egg collection, phenotypic data collection, blood collection, DNA isolation, DNA amplification, electrophoresis, and sequencing. Parameters that will be observed are DOC weight for the first seven weeks, qualitative and quantitative phenotypic characters, and polymorphism of the IGF-1 gene. Data analysis was performed using Microsoft Excel, Genestudio, MEGA11, and IBM SPSS 25 software. Sequencing data were processed using the Genestudio application, alignment with MEGA11, and genotype-haplotype associations using SPSS (Pearson correlation and Linear Regression F test). The results showed that the molecular marker polymorphism of the IGF-1 gene was found at 12 mutation points. These mutations include substitution mutations at 4 points and insertion mutations at 8 points. The results showed that the IGF-1 gene polymorphism had no correlation and had a significant effect on the weight of F5 Golden Kamper chickens. The inbreeding coefficient value obtained is 0,375, shows that individual F5 Golden Kamper chickens have low genetic uniformity in a population.

Kata Kunci : ayam, gen IGF-1, koefisien inbreeding, pertumbuhan