Eksplorasi Bakteri Pendegradasi Biofilm Xanthomonas oryzae pv. oryzae

ULVANA TRI NURWULAN, Prof. Dr. Ir. Triwidodo Arwiyanto, M,Sc.

2023 | Skripsi | S1 PROTEKSI TANAMAN

Padi (Oryza sativa L.) merupakan tanaman pangan pokok bagi masyarakat Indonesia. Salah satu kendala dalam peningkatan produktivitas padi yaitu penyakit hawar daun bakteri yang disebabkan oleh Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo). Xoo memiliki kemampuan dalam membentuk biofilm sebagai struktur ketahanan, mempengaruhi virulensi dalam proses infeksi dan berperan penting dalam perkembangan penyakit. Streptomyces spp. merupakan salah satu organisme tanah yang bermanfaat dalam pengendalian hayati. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi Streptomyces spp.   dari tanah dan mengetahui potensi isolat Streptomyces spp. yang diperoleh dalam mendegradasi biofilm Xoo. Penelitian dilakukan dengan mengisolasi Streptomyces spp. dari tanah pertanaman padi di daerah Yogyakarta pada media CSA dan WYE. Uji penghambatan biofilm dilakukan dengan mencampurkan suspensi Streptomyces spp. dan Xoo pada microplate kemudian diamati terbentuknya cincin berwarna ungu sebagai tanda pembentukan biofilm. Berdasarkan penelitian yang telah dilakukan, diperoleh 6 isolat yang diduga merupakan Streptomyces spp. berdasarkan karakteristik morfologinya. Pada uji antagonisme isolat Streptomyces spp. yang paling banyak menghambat pertumbuhan isolat Xoo yaitu isolat Bs(2) dan Bs(3) dengan total 95% penghambatan. Isolat Xoo yang paling rentan oleh isolat Streptomyces spp. yaitu isolat BaK2 dan SlPk1. Ke-enam isolat menunjukkan hasil negatif pada uji hipersensitif dan patogenisitas serta memiliki mekanisme penghambatan secara bakteriostatik. Pada uji penghambatan pembentukan biofilm isolat KpNg1, SGg, KpS dan Bs(2) memiliki kemampuan yang baik dalam menghambat pembentukan biofilm Xoo. Pada isolat Bs(1) dan Bs(3) memiliki kemampuan yang rendah dalam menghambat pembentukan biofilm Xoo.

Rice (Oryza sativa L.) is a staple food for Indonesian people. One of the challenges in increasing rice productivity is bacterial leaf blight caused by Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo). Xoo has the ability to form biofilms as a resistance structure, affecting virulence in the infection process and play an important role in disease development. Streptomyces spp. is one of the soil organisms that are useful in biological control. This study aims to isolate Streptomyces spp. from soil and determine the potential of Streptomyces spp. in degrading Xoo biofilm. The research was conducted by isolating Streptomyces spp. from rice field soil in Yogyakarta on CSA and WYE media. Biofilm inhibition test was conducted by mixing suspension of Streptomyces spp. and Xoo on a microplate then observed the formation of a purple ring as a sign of biofilm formation. The results showed that 6 isolates are suspected to be Streptomyces spp. based on its morphological characteristics. In the antagonism test, isolates Bs(2) and Bs(3) were able to inhibit 95% of the growth of Xoo. The most susceptible Xoo isolates against Streptomyces spp. isolates were BaK2 and SlPk1. All six isolates showed negative results in hypersensitivity and pathogenicity tests and had bacteriostatic inhibition mechanisms. In inhibition of biofilm formation test, KpNg1, SGg, KpS and Bs(2) isolates has good ability to inhibit Xoo biofilm formation, meanwhile isolates Bs(1) and Bs(3) have a low ability to inhibit Xoo biofilm formation.

Kata Kunci : Penyakit hawar daun bakteri, Xanthomonas oryzae pv. oryzae, Streptomyces spp., biofilm, tanaman padi