Identifikasi Polimorfisme Insersi/ Delesi pada Gen Growth Hormone Receptor (GHR) dan Asosiasinya terhadap Litter Size Domba Sakub (Ovis aries)
Zulfa Adha Fauziyyah, Prof. Dr. drh. Aris Haryanto, M.Si.
2023 | Skripsi | KEDOKTERAN HEWAN
IDENTIFIKASI POLIMORFISME
INSERSI/DELESI PADA GEN GROWTH HORMONE
RECEPTOR (GHR) DAN ASOSIASINYA TERHADAP LITTER
SIZE DOMBA SAKUB (Ovis aries)
Zulfa
Adha Fauziyyah
19/439061/KH/10071
Domba merupakan
ternak ruminansia yang berpotensi memenuhi kebutuhan protein hewani masyarakat
Indonesia. Domba Sakub merupakan salah satu domba lokal yang berasal dari
Kabupaten Brebes, Jawa Tengah. Penelitian ini bertujuan untuk menelusuri
kejadian mutasi pada gen Growth Hormone
Receptor (GHR) domba Sakub dan asosiasinya dengan litter size. Growth Hormone
Receptor (GHR) merupakan protein yang berada pada permukaan sebagai
reseptor yang dibutuhkan oleh Growth
Hormone (GH) untuk membawa pengaruhnya ke target jaringan dan berperan
dalam pertumbuhan preimplementasi.
Sebanyak 85 ekor
induk domba Sakub di Kecamatan Paguyangan, Kabupaten Brebes diidentifikasi
paritas dan litter size-nya serta
diambil sampel folikel rambutnya. Sampel rambut tersebut kemudian dibawa ke
Laboratorium Biokimia dan Biologi Molekuler, FKH UGM untuk dilakukan isolasi whole DNA dan amplifikasi. Amplifikasi
DNA dilakukan menggunakan teknik Touchdown
Polymerase Chain Receptor (TD-PCR) menggunakan dua pasang primer GHR-1 Produk
PCR dilakukan elektroforesis menggunakan gel agarosa 3,5?n divisualisasikan
pada UV transilluminator. Analisis statistik dilakukan menggunakan perangkat
lunak SPSS versi 25 dengan uji one-way ANOVA dan uji Chi-square.
Berdasarkan hasil analisis statistik, nilai Polymorphism Information Content (PIC) dari GHR-1 dan GHR-2 adalah 0,37 dan 0,34, masing-masing menunjukkan polimorfisme genetik yang tinggi pada domba Sakub. Selain itu, varian delesi pada gen GHR secara signifikan berasosiasi dengan litter size domba Sakub (p <0>
IDENTIFIES POLYMORPHISM INSERTIONS/DELETIONS IN THE
GROWTH HORMONE RECEPTOR (GHR) GENE AND ITS ASSOCIATION WITH LITTER SIZE OF SAKUB
SHEEP (Ovis aries)
Zulfa
Adha Fauziyyah
19/439061/KH/10071
Sheep is a type of ruminant livestock
that has the potential to meet the animal protein needs of the Indonesian
people. Sakub sheep is one of the local sheep originating from Brebes Regency,
Central Java. This study aims to to trace the incidence of mutations in the
Growth Hormone Receptor (GHR) gene in Sakub sheep and its association with
litter size. Growth Hormone Receptor (GHR) is a cell surface receptor needed by
the GH gene to carry its effects to target tissues and play a role in
preimplementation growth.
A total of 85 Sakub sheeps reared by
breeders in Paguyangan District, Brebes Regency were identified for parity and
litter size and hair follicle samples were taken. The hair samples then taken
to the Laboratory of Biochemistry and Molecular Biology, Faculty of Veterinary
Medicine for whole DNA isolation and
amplification. Amplification was performed using Touchdown Polymerase Chain
Receptor (TD-PCR) technique using two pairs of primers GHR-1 and GHR-2. The PCR
product was electrophoresed using an agarose gel with a concentration of 3.5%
and visualized on a UV transilluminator. Statistical analysis was carried out
using SPSS software version 25 with a one-way ANOVA test and Chi-square test.
Based on the results of statistical analysis, the Polymorphism Information Content (PIC) values of GHR-1 and GHR-2 were 0.37 and 0.34, respectively indicating high genetic polymorphism in Sakub sheep. In addition, the deletion variants in the GHR gene were significantly correlated with the litter size of the Sakub sheep (p <0>
Kata Kunci : Domba Sakub, GHR, Delesi, Litter Size
