DETEKSI POLIMORFISME INSERSI/DELESI (INDEL) VARIAN GEN Ewing Tumor-Associated Antigen 1 (ETAA1) DAN ASOSIASINYA TERHADAP SIFAT PERTUMBUHAN PADA DOMBA SAKUB

Zulfa Ihza Khairunnisa, Prof. Dr. drh. Aris Haryanto, M.Si.

2023 | Skripsi | KEDOKTERAN HEWAN

Ewing’s Tumor Association Antigen 1 (ETAA1) adalah salah satu kandidat

gen yang mempunyai pengaruh terhadap sifat pertumbuhan dan ukuran tubuh pada

domba. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi adanya variasi polimorfisme

insersi/delesi (Indel) pada gen ETAA1 yang diasosiasikan terhadap sifat

pertumbuhan dan ukuraan tubuh pada komoditas unggul domba varietas baru yaitu

Domba Sakub. Sampel yang diambil sebanyak 151 Domba Sakub. Genotyping

dilakukan dari folikel rambut domba yang diisolasi DNA, amplifikasi PCR, dan

elektroforesis dengan gel agarose 3,5%. Perhitungan polymorphism information

content (PIC) lokul indel-8bp terhitung memiliki nilai yang cukup informatif untuk

dijadikan marker genetik yaitu PIC = 0,373. Analisis data dengan ANOVA

dilakukan untuk mengetahui adanya asosiasi gen ETAA1 dengan sifat pertumbuhan

ukuran tubuh. Analisis yang didapatkan menjelaskan bahwa indel-8bp-ETAA1

secara signifikan terasosiasi dengan sifat-sifat pertumbuhan yaitu tinggi gumba,

bobot badan, dalam leher, tinggi pinggul pada Domba Sakub jantan, dan lebar dada,

dalam leher, lebar ambing, lebar pinggul, lebar ekor tengah, dalam pinggul, panjang

badan pada Domba Sakub betina dengan umur yang telah dikategorisasikan.

Domba Sakub jantan dan betina pada umumnya memiliki kecenderungan genotip

ID yang lebih signifikan tinggi berasosiasi dengan ukuran tubuh daripada genotip

II dan DD. Hal ini dapat menunjukkan bahwa indel-8bp gen ETAA1 terkonfirmasi

berasosiasi dengan sifat pertumbuhan ukuran tubuh pada Domba Sakub, dan gen

ETAA1 berpotensi untuk dijadikan sebagai marker genetik dalam program seleksi

induk unggul.

Ewing's Tumor Association Antigen 1 (ETAA1) is one of the candidate genes

that has an associated with growth traits and body size in sheep. This study directed

to identify the variation of insertion/deletion polymorphism (Indel) in the ETAA1

gene which is associated with growth traits and body size in the high-quality

commodity of the new sheep variety, that is Sakub Sheep. The samples taken were

151 Sakub sheep. Genotyping was performed from isolated sheep hair follicles,

PCR amplification, and electrophoresis with 3.5% agarose gel. Calculation of the

polymorphism information content (PIC) of the indel-8bp locus is calculated to

have a value that is informative enough to be used as a genetic marker, with PIC =

0.373. Data analysis using ANOVA was carried out to determine the association of

the ETAA1 gene with the growth trait of body size. The analysis explained that

indel-8bp-ETAA1 was significantly associated with growth traits, such as height at

the hp cross, body weight, neck depth, hip height in male Sakub sheep, and chest

width, neck depth, udder width, hip width, middle tail width, inside hip, body length

in female Sakub Sheep. There is categorized with age. In general, male and female

Sakub sheep had a tendency for the ID genotype to be significantly higher in

association with body size than genotypes II and DD. This could indicate that the

indel-8bp ETAA1 gene was confirmed to be associated with the growth trait of

body size in Sakub sheep, than the ETAA1 gene has potential to be used as a genetic

marker in superior broodstock selection programs in sheep breeding.

Kata Kunci : gen ETAA1, domba sakub, indel, sifat pertumbuhan