Analisis Infeksi Ganda Begomovirus dan Potyvirus Pada Melon (Cucumis melo L. 'Hikapel')
Prima Sekti Kusnanda, Prof. Dr. Budi Setiadi Daryono, M.Agr.Sc.
2023 | Skripsi | BIOLOGI
Tanaman melon (Cucumis melo L.) merupakan salah
satu tanaman penting dalam industri hortikultura. Penelitian dan pengembangan
kultivar baru telah banyak dilakukan, salah satunya yaitu melon ‘Hikapel’ yang
dihasilkan oleh Fakultas Biologi UGM. Saat ini permasalahan utama budidaya
melon adalah serangan hama dan penyakit, khususnya akibat virus. Begomovirus
merupakan salah satu virus yang menginfeksi familia Cucurbitaceae. Virus lain
yang dapat menginfeksi melon yaitu genus Potyvirus. Banyaknya kelompok
virus yang memiliki inang yang sama dapat mengakibatkan terjadinya infeksi
ganda. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi secara molekuler infeksi ganda
Begomovirus dan Potyvirus pada melon ‘Hikapel’ serta untuk
mengetahui respons populasi melon ‘Hikapel’ terhadap infeksi ganda Begomovirus
dan Potyvirus. Metode penelitian yang digunakan yaitu pengamatan morfologis
dan skoring, ekstraksi DNA,
pengukuran kuantitatif DNA, amplifikasi DNA dengan PCR menggunakan primer Krusty
homer, ekstraksi RNA, pengukuran kuantitatif RNA, sintesis cDNA, pengukuran
kuantitatif cDNA, amplifikasi cDNA dengan PCR menggunakan primer Potyviruses 1
dan Potyviruses 2, serta elektroforesis. Hasil analisis molekuler menunjukkan dengan
penanda molekuler primer Krusty Homer dan Potyviruses 1 dan Potyviruses 2 yaitu
terdapat band DNA pada ±550 bp dan ±600 bp yang mengindikasi infeksi Begomovirus
dan Potyvirus. Respons populasi tanaman melon terhadap infeksi ganda Begomovirus
dan Potyvirus menunjukkan sifat resisten terhadap virus karena
jumlah persentase tanaman terinfeksi di bawah 10%.
Melon
plant (Cucumis melo L.) is one of the important plants in the
horticulture industry. Much research and development of new cultivars melon has
been carried out, one of which is the 'Hikapel' developed by the Faculty of
Biology UGM. Currently, the main problem in melon cultivation is pest and
disease attacks, especially due to viruses. Begomovirus is a virus that
infects the Cucurbitaceae family. In addition, another virus that can infect
melons is from the genus Potyvirus. Many groups of viruses that have the
same host can result in multiple infections. This study aims to detect
molecularly the double infection of Begomovirus and Potyvirus in
'Hikapel' melons and to determine its population response. The methods used in
this research were morphological observation and scoring, DNA extraction,
quantitative DNA measurement, DNA amplification with PCR method using Krusty
Homer primer, RNA extraction, RNA quantitative measurement, cDNA synthesis,
cDNA quantitative measurement, cDNA amplification with PCR method using
Potyviruses 1 and Potyviruses 2 primer, and electrophoresis. The results of
molecular analysis showed that with the primary molecular markers Krusty Homer and
Potyviruses 1 and Potyviruses 2, there were DNA bands at ±550 bp and ±600 bp
which indicated Begomovirus and Potyvirus infections. The population responses
of the melon plant to double infection of Begomovirus and Potyvirus showed
resistance to the virus because the total percentage of infected plants was
below 10%.
Kata Kunci : Begomovirus, Hikapel, Infeksi Ganda, Melon, Potyvirus.