IDENTIFIKASI MOLEKULER SPESIES VIRUS ANGGOTA GENUS Begomovirus PADA TANAMAN KACANG PANJANG POLIKULTUR

REVINA ANUGRAH AYU, Dr. Ir. Sedyo Hartono, M.P.

2021 | Skripsi | S1 PROTEKSI TANAMAN

Polikultur merupakan upaya diversifikasi tanaman guna meningkatkan produktivitas tanaman. Penentuan jenis tanaman budidaya dengan sistem polikultur berperan penting dalam persebaran dan keanekaragaman Begomovirus. Begomovirus merupakan virus tanaman yang memiliki inang sangat luas. Petani di Provinsi DI Yogyakarta mayoritas menanam kacang panjang secara polikultur dengan tanaman lain. Kacang panjang (Vigna sinensis L.) merupakan salah satu spesies tanaman yang merupakan inang dari Begomovirus. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui spesies virus anggota genus Begomovirus yang menyerang tanaman kacang panjang polikultur. Pengamatan dilakukan di lahan campuran kacang panjang yang berada di Girisekar, Gunungkidul; Selopamioro, Bantul; Karangtengah, Bantul; Kalitirto, Sleman dengan menghitung kejadian penyakit dan intensitas penyakit, variasi gejala, dan pengambilan sampel. Sampel bergejala diamplifikasi dengan teknik Polymerase Chain Reaction (PCR) menggunakan primer universal Begomovirus yaitu Krusty-Homer. Hasil PCR menunjukkan bahwa sampel tanaman positif terinfeksi oleh Begomovirus ditandai dengan munculnya pita berukuran ±580bp. Hasil analisis sekuens DNA Begomovirus isolat kacang panjang menunjukkan homologi tertinggi dengan Mungbean yellow mosaic India virus (MYMIV; Acc. No. JN368438) yaitu berturut-turut isolat Selopamioro, Bantul (98,16%), diikuti isolat Karangtengah, Bantul (98,04%), isolat Kalitirto, Sleman (97,24%), dan Girisekar, Gunungkidul (96,41%). Laporan ini menjadi informasi terbaru penyebaran MYMIV di Provinsi DI Yogyakarta.

Polyculture is an effort to diversify crops to increase crop productivity. Determination of the type of cultivated plants with a polyculture system played an important role in the distribution and diversity of Begomovirus. Begomovirus is a plant virus that has a very wide host. Farmers in DI Yogyakarta Province mostly cultivate long beans polyculture with other crops. Long beans (Vigna sinensis L.) are a species of plant that is the host of Begomovirus. This study aims to find out the virus species of members of the genus Begomovirus that attack polyculture long bean plants. Observations were made on the land of long bean mixture located in Girisekar, Gunungkidul; Selopamioro, Bantul; Karangtengah, Bantul; Kalitirto, Sleman by calculating the incidence of disease and the intensity of the disease, variations in symptoms, and sampling. Leaf samples of plants with Begomovirus symptoms were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique using the Krusty-Homer universal primer. The PCR results showed that samples of plants positively infected by Begomovirus with a band size of a ±580bp. Sequence analysis of begomovirus isolated from long beans showed the highest DNA homology with Mungbean yellow mosaic India virus (MYMIV; Acc. No. JN368438), the isolates were Selopamioro, Bantul (98.16%), Karangtengah, Bantul (98.04%), Kalitirto, Sleman (97.24%), and Girisekar, Gunungkidul (96.41%), respectively. This report is the latest information on the spread of MYMIV in DI Yogyakarta Province.

Kata Kunci : Polikultur, kacang panjang, Begomovirus, PCR, MYMIV