Identifikasi Molekuler Gracilaria spp. dari Zona Intertidal di Pantai Siung dan Watu Kodok Kabbupaten Gunungkidul Menggunakan Penanda Mitokondria Cytochrome Oxidase Subunit 1

KURNIA ANGGRAINI RAHMI, Dr. Ratih Ida Adharini, S.Pi., M.Si.

2021 | Skripsi | S1 MANAJEMEN SUMBERDAYA AKUATIK

Alga merupakan salah satu sumber daya yang sangat melimpah di Indonesia. Faktor lingkungan mempengaruhi distribusi dan morfologi alga. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi beberapa jenis spesies Gracilaria spp. yang ada di Pantai Siung dan Pantai Watu Kodok berdasarkan DNA barcoding serta hubungan kekerabatannya. Pengambilan sampel alga dilakukan pada bulan September 2020 di Pantai Siung dan Pantai Watu Kodok, Gunung Kidul, Yogyakarta. Metode yang digunakan dalam penelitian ini yaitu analisis molekuler DNA barcoding dengan marker COI. Spesies Gracilaria spp. yang ditemukan yaitu jenis Gracilaria edulis di Pantai Siung dengan percent identity 99,25% dengan accession number KY995677.1 dan Gracilaria sp. di Pantai Watu Kodok dengan percent identity 91,87% dengan accession number MG199570.1. Berdasarkan analisis filogenetik, sampel Gracilaria edulis yang didapatkan dari Pantai Siung memiliki nilai kekerabatan 0,01 dengan Gracilaria edulis yang ditemukan di Metro Manila, Filipina.

Seaweed is one of the most abundant resources in Indonesia. Environmental factors can influence the distribution and morphology of seaweed. This research aims identify several types of Gracilaria spp. in Siung and Watu Kodok beach based on DNA barcoding and their relationship. Seaweed sampling was carried out in September 2020 at Siung beach and Watu Kodok beach, Gunung Kidul, Yogyakarta. The method that used in this research was molecular analysis of DNA barcoding with COI marker. Spesies Gracilaria sp. that found were Gracilaria edulis in Siung beach with percent identity 99.25% with accession number KY995677.1 and Gracilaria sp. in Watu Kodok beach with percent identity 91.87% with accession number MG199570.1. Based on phylogenetical analysis, sample of Gracilaria edulis from Siung beach has a relationship value of 0,01 with Gracilaria edulis that found in Metro Manila, Philippines.

Kata Kunci : DNA barcoding/Barcoding DNA, Gracilaria spp./Gracilaria spp., molekuler/molecular, Pantai Siung/Siung Beach, Pantai Watu Kodok/Watu Kodok Beach