THE FREQUENCY DISTRIBUTION OF CYP2B6*9 GENE POLYMORPHISMS IN JAVANESE POPULATION

FAISAL RAHMAN, Prof. Dr. Zullies Ikawati, Apt.; dr. Ahmad Hamim Sadewa, Ph.D

2020 | Tesis | MAGISTER FARMASI KLINIK

Polimorfisme gen yang menyandi berbagai enzim hati menyebabkan modifikasi aktivitas enzimatik. Polimorfisme enzim mempengaruhi respon obat secara langsung atau tidak langsung. CYP2B6 adalah anggota dari superfamili sitokrom P450. Varian genetik CYP2B6 berkontribusi pada perubahan metabolisme obat dan konsentrasi plasma yang berbeda. Enzim ini memetabolisme sejumlah obat dan senyawa yang berbeda. Dari polimorfisme nukleotida tunggal CYP2B6 yang diketahui, CYP2B6*9 (c.516G> T, g.15631, Q172H, rs 3745274) di ekson 4, adalah yang paling umum, dan menunjukkan variabilitas antar-etnis yang cukup besar. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui frekuensi sebaran alel polimorfisme gen CYP2B6*9 pada penduduk asli Jawa. Sebuah studi cross-sectional akan dilakukan pada 89 subjek. Skrining genetik untuk polimorfisme CYP2B6*9 akan dilakukan dengan metode modifikasi allele-specific polymerase chain reaction (PCR). Distribusi genotipe 516G/T CYP2B6 berikut pada populasi Jawa diidentifikasi: GG - 4,5%, GT - 88,8% dan TT - 6,7%. Frekuensi alel 516G/T dari gen CYP2B6 dalam populasi adalah G = 48,88% dan T = 51,12%. Urutan berbasis populasi dianalisis dengan metode Hardy-Weinberg. Frekuensi polimorfisme CYP2B6 516G>T pada etnis Jawa lebih rendah dibandingkan pada populasi lain.

Gene polymorphisms that encode various liver enzymes cause modification of the enzymatic activity. Enzyme polymorphisms affect drug responses directly or indirectly. CYP2B6 is a member of the cytochrome P450 superfamily. The CYP2B6 genetic variants contribute to altered drug metabolism and differential plasma concentrations. This enzyme metabolizes several different drugs and compounds. Of the known CYP2B6 single nucleotide polymorphisms, CYP2B6*9 (c.516G>T, g.15631, Q172H, rs 3745274) in exon 4, is the most common and shows considerable inter-ethnic variability. The purpose of this study is to determine the frequency of gene polymorphism allele distribution CYP2B6*9 in the native Javanese population. A cross-sectional study will be conducted on 89 subjects. Genetic screening for CYP2B6*9 polymorphism will be carried out by a modified allele-specific polymerase chain reaction (PCR) method. The following distribution of 516G/T CYP2B6 genotypes in the Javanese population was identified: GG – in 4,5%, GT – in 88,8%, and TT – in 6,7%. The 516G/T allele frequency of the CYP2B6 gene in population was G = 48,88% and T = 51,12%, respectively. The population-based sequences were analyzed by the Hardy-Weinberg method. The frequency of CYP2B6 516G> T polymorphism in Javanese is lower than in other populations.

Kata Kunci : CYP2B6*9, 516G/T, gene polymorphism, allele-specific PCR