TEKNIK ISOLASI DEOXYRIBOSE-NUCLEIC ACID (DNA) BAKTERI GRAM POSITIF DARI KASUS MASTITIS KAMBING PERANAKAN ETAWA TAHUN 2019

NOVIANTIKA RAHMA, drh. Clara Ajeng Artdita, M. Sc.

2020 | Tugas Akhir | D3 KESEHATAN HEWAN

Susu Kambing Peranakan Etawa (PE) banyak digemari oleh masyarakat karena memiliki banyak manfaat.Masalah yang paling banyak merugikan peternak kambing perah adalah kasus mastitis.Penyebab utama mastitis adalah infeksi bakteri.Identifikasi bakteri secara genotyping memiliki keakuratan lebih tinggi apabila dibandingkan dengan metode biokimia konvensional.Analisis molekuler selalu diawali dengan isolasi DNA.Isolasi DNA bertujuan untuk memisahkan DNA kromosom dari komponen sel lainnya.Tujuan dari penulisan Tugas Akhir ini adalah untuk mendapatkan DNA yang murni.Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode isolasikonvensional dan metode protokol Geneaid.Isolat bakteri diambil dari hasil uji fenotipe sebelumnya yang terkonfirmasi bakteri Gram positif.Uji kualitatif menggunakan gel agarosa 1% selanjutnya divisualisasikan dengan UV transilluminator.Hasil pita DNA untuk metode konvensional terlihat kurang jelas dan smearapabiladibandingkan dengan hasil pita DNA yang menggunakan isolasi DNA berdasarkan protokol Geneaid.

Etawa crossbreed goat milk has many benefits, so that many people prefer consuming goat milk to cow milk. The most common problem that affecting goat farmer is mastitis. Mostly mastitis is caused by bacteria infection. Genotyping identification has high accuracy than biochemistry conventional method. Molecular anaylisis always start with DNA isolation. The purpose of DNA isolation is to separate DNA from other cellular component. The goal of this final task is to get the result of pure DNA isolation. Method used in this research is conventional isolation method and protocol Geneaid method. Bacteria isolates were taken from phenotype test result that confirmed Staphylococcus aureus. Qualitative test using agarose gel 1% visualized with UV transilluminator, DNA bands looks thin and smear. This qualitative method shows that the result of DNA isolation has low concentration and still have any contaminants or DNA were interrupted during the isolation process.

Kata Kunci : Mastitis, bakteri Gram positif, teknik isolasi DNA, metode konvensional, metode protokol Geneaid