TEKNIK IDENTIFIKASI BAKTERI Mycoplasma pulmonis MENGGUNAKAN POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR) DI NATIONAL LABORATORY ANIMAL CENTER MAHIDOL UNIVERSITY
YUDA DISASTRA, drh. Fajar Budi Lestari, M. Biotech
2019 | Tugas Akhir | D3 KESEHATAN HEWANMycoplasmosis merupakan penyakit kronis pada manusia dan hewan yang disebabkan oleh bakteri Mycoplasma. Bakteri Mycoplasma yang sering ditemukan pada hewan percobaan seperti tikus dan mencit adalah Mycoplasma pulmonis (M. pulmonis). Mycoplasma pulmonis merupakan bakteri yang menyebabkan penyakit murine respiratory mycoplasmosis. Mycoplasma pulmonis dapat menyebar luas di hospes dan mempengaruhi sejumlah sistem organ. Paru-paru dan trakea merupakan predileksi utama. Tujuan dari pengujian ini adalah untuk mendeteksi keberadaan M. pulmonis pada hewan percobaan yang ada di National Laboratory Animal Center (NLAC) Mahidol University, Thailand. Keberadaan bakteri M. Pulmonis dideteksi dengan menggunakan teknik polymerase chain reaction (PCR). Sampel yang digunakan adalah sampel organ dari paru-paru dan trakea dari hewan tikus, mencit, marmut, dan hamster yang diekstraksi sampel DNA-nya. Gen target yang digunakan yaitu 16s RNA. Target amplikon berukuran 266 base pair (bp). Primer forward dengan urutan DNA: 5'-AGC - GTT - TGC - TTC - ACT- TTG - AA 3' dan primer reverse dengan urutan DNA: 5'-GGG - CAT - TTC - CTC - CCT - AAG - CT-3'. Hasil PCR dilanjut dengan elektroforesis menggunakan gel agarose 3% dan divisualisasi dengan gel doc. Hasil PCR menunjukkan tidak ada pita yang terbentuk. Kesimpulan yang didapat adalah semua sampel yang digunakan tidak terinfeksi bakteri M. pulmonis dan layak digunakan sebagai hewan percobaan.
Mycoplasmosis is a chronic disease for humans and animals. Mycoplasma which is often found in laboratory animal such as mice and mice is Mycoplasma pulmonis (M. pulmonis). Mycoplasma. pulmonis is a bacteria that causes murine respiratory mycoplasmosis disease. Mycoplasma pulmonis can spread widely in the host and affect a number of organ systems. The lung and trachea are the main predilection. The purpose of this testing was to detect the presence of M. pulmonis in experimental animals at the National Animal Laboratory Center (NLAC), Mahidol University, Thailand. The presence of bacteria M. pulmonis was detected using polymerase chain reaction (PCR) techniques. The sample used was a sample of organs from the lung and trachea of rat, mice, guinea pigs, and hamsters extracted into DNA samples. The target gene used is 16s RNA. The target amplicon requires 266 base pairs (bp). Primary forward with DNA sequence: 5'-AGC - GTT - TGC - TTC - ACT-TTG - AA 3 'and reverse primer with DNA sequence: 5'-GGG - CAT - TTC - CTC - CCT - CCT - AAG - CT- 3 '. The PCR results were electrophoresed using agarose gel 3% and visualized with doc gel. The PCR results showed there was no bands were formed, it can be concluded that all animal samples in NLAC did not have M. pulmonis bacteria and so the animals suitable for use as experimental animals.
Kata Kunci : Mycoplasmosis, Mycoplasma pulmonis, polymerase chain reaction (PCR), National Laboratory Animal Center (NLAC), Mahidol University