Deteksi dan Karakterisasi Gen Ketahanan terhadap Penyakit (Pto) pada Beberapa Spesies Anggrek

Riza Annisa Fauziah, Dr. Tri Joko, S.P.,M.Sc

2019 | Skripsi | S1 PROTEKSI TANAMAN

Anggrek merupakan tanaman yang banyak digemari dan telah menjadi komoditas ekspor Indonesia. Tanaman ini memiliki bunga dengan bentuk yang beragam sehingga menarik bagi kolektor. Penyakit yang dapat menyerang tanaman anggrek salah satunya yaitu penyakit busuk lunak yang disebabkan oleh bakteri Pectobacterium carotovorum. Bakteri tersebut dapat menyerang seluruh bagian tanaman dan meluas dengan cepat bahkan menyebabkan kematian pada tanaman anggrek. Dewasa ini ditemukan jalur persinyalan yang dapat mengaktifkan ketahanan tanaman terhadap patogen. Pto merupakan suatu bentuk jalur persinyalan yang memberikan resistensi terhadap bakteri strain P. syringae pv. tomato pada tanaman tomat. Pto memiliki protein yang berperan dalam pengenalan awal terjadinya infeksi dan proses transduksi sinyal untuk mengaktifkan mekanisme ketahanan ketika tanaman terinfeksi. Dilakukan deteksi dan karakterisasi gen ketahanan Pto pada 13 spesies anggrek dengan menggunakan PCR dengan primer degenerate dan analisis pohon filogenetika. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 13 spesies anggrek yaitu Eria hyacinthoides, Phalaenopsis amabilis, Vanda helvola, Papalopedium javanicum, Coelogyn trinervis, Rhynchostylis retusa, Oncidium millenium gold, Cymbidium atropurpureum, Maxillaria tenuifolia, Dendrobium phalaenopsis, Bulbophilum lepidum, Phaius tankervilleae alba dan Ascocentrum miniatum telah berhasil diidentifikasi adanya gen ketahanan Pto dan analisis filogenetika menyatakan 13 spesies anggrek masuk ke dalam kelas ke VIII PKs (Protein Kinase Superfamily) dari kelas utama resistensi tanaman

Orchid is one of the worldwide favorite plant and has become an important Indonesian export commodity. Orchid has numerous variety of flower shape, which is attractive for the collectors. One of the diseases that attack orchid plants is soft rot caused by the bacterium Pectobacterium carotovorum. These bacteria attack all parts of the plant, and expand quickly which eventually cause death in orchid plants. Currently had been found signaling pathways to activate plant resistance againts pathways had been found. Pto is a signaling pathway on tomato plants that provides resistance to bacterial strains of Pseudomonas syringae pv. tomato . Pto is a protein which has essential role in initial host recognition, and lead to signal transduction, a process why resistance mechanism is activated after infection. In this paper, 13 orchids species are detected using degenerate polymerase chain reaction (PCR) primers and characterized with phylogenetic tree analysis. Pto-like gene was succesfully amplified from those species and based on phylogenetic trees, it was showed that 13 the Pto-like genes was grouped in to VIII Pks (Protein Kinase Superfamily) clade.

Kata Kunci : Kata kunci : Pto, 13 spesies anggrek, primer degenerate, analisis filogenetika, PKs (Protein Kinase Superfamily)/Keywords: Pto, 13 orchids species, degenerate primer, phylogenetic analysis, PKs (Protein Kinase Superfamily)