IDENTIFIKASI MORFOLOGI DAN MOLEKULER AMPHISTOMES PADA GAJAH SUMATERA (Elephas maximus sumatranus) DI TAMAN NASIONAL WAY KAMBAS
LINTANG W. FIRDAUSY, Dr. drh. R. Wisnu Nurcahyo; Dr. drh. Soedarmanto Indarjulianto
2018 | Tesis | MAGISTER SAINS VETERINERAmphistomes merupakan salah satu anggota phylum Platyhelminthes yang berdasarkan bentuk tubuhnya digolongkan ke dalam superfamily Paramphistomoidea. Parasit ini memiliki distribusi penyebaran yang luas dan mampu menginfeksi berbagai jenis vertebrata. Kejadian amphistomiasis di Indonesia sering terjadi, baik pada ternak maupun beberapa satwa liar endemik, seperti Gajah Sumatera, tetapi jenis spesifik amphistomes yang menginfeksi, sangat jarang dilaporkan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui morfologi, ultrastruktur, dan data sekuen molekul DNA trematoda yang menginfeksi Gajah Sumatera. Sampel yang digunakan berupa amphistomes yang berasal dari Gajah Sumatera yang berada di kawasan ERU Tegal Yoso (amphistome T), ERU Margahayu (amphistome M), dan ERU Bungur (amphistome B). Metode yang digunakan dalam penelitian ini yaitu pengecatan menggunakan Semichon's camine untuk identifikasi morfologi, scanning electron microscope (SEM) untuk melihat ultrastruktur amphistomes, serta Polymerase Chain Reaction (PCR) menggunakan primer Internal Transcribed Spacer 2 (ITS2) GA1 (5'-AGA ACA TCG ACA TCT TGA AC-3') dan BD2 (5'-TAT GCT TAA ATT CAG CGG GT-3') untuk identifikasi molekuler. Hasil pengecatan diidentifikasi menggunakan kunci identifikasi trematoda dan hasil sekuen nukleotida diolah lebih lanjut menggunakan software MEGA dan BLAST. Hasil identifikasi morfologi menunjukan bahwa ada dua jenis amphistomes, salah satu diduga berasal dari genus Pfenderius sp., yaitu amphistome T, sedangkan amphistomes M dan B berasal dari superfamily Paramphistomoidea. Hasil pemeriksaan ultrastruktur sampel amphistomes T, M, dan B tidak menunjukan adanya bagian spesifik yang hanya dimiliki oleh spesies tertentu, sehingga pemeriksaan menggunakan SEM kurang mendukung proses identifikasi. Analisis hasil sekuen didapatkan 317 nukleotida dengan perbedaan antara amphistome M dengan B sebanyak 0 nukleotida dan amphistome T dengan M maupun B sebanyak 44 nukleotida. Amphistome T memiliki kekerabatan terdekat dengan Paramphistomidae sp. (MF678652) dan Paramphistomum cervi (KU365321) dengan jarak genetik 14,6%, sedangkan amphistome M dan B memiliki kekerabatan yang dekat dengan Gastrodiscoides hominis (KT777941) dengan jarak genetik sebesar 2,3%
Amphistomes is a members of the Platyhelminthes. Based on their body shape are classified into the superfamily of Paramphistomoidea. This parasite has a wide distribution and capable to infecting various of vertebrates. The occurrence of amphistomiasis in Indonesia are common both in livestock and some endemic wildlife, such as Sumatran elephants, but the specific species that caused amphistomiasis are rarely report. The aim of this study is to identify the amphistomes from Sumatran elephant using the morphology, ultrastructure, and sequence data of amphistomes DNA. Amphistomes were collected from Sumatran elephants that lived in ERU Tegal Yoso (amphistome T), ERU Margahayu (amphistome M), and ERU Bungur (amphistome B). The methods used in this research were staining for morphological identification using Semichon's camine method, scanning electron microscope (SEM) to see ultrastructure amphistomes, and Polymerase Chain Reaction (PCR) using Transcribed Spacer 2 (ITS2) GA1 (5'-AGA ACA TCG ACA TCT TGA AC-3 ') and BD2 (5'-TAT GCT TAA ATT CAG CGG GT-3') for molecular identification. Morphological identification were identified using trematode key identification and the sequences of nucleotide data were analyzed using MEGA and BLAST. The results of morphological identification showed that there were two types of amphistomes. Amphistome T was allegedly originated from the genus of Pfenderius sp., while amphistomes M and B were from the superfamily of Paramphistomoidea. Ultrastructure examination results of amphistomes T, M, and B did not show any specific parts that only certain species have, so examination using SEM did not support the identification process. Sequent analysis result obtained 317 nucleotides. The number of difference between amphistomes M and B was 0 nucleotide, while amphistome T with amphistomes M and B were 44 nucleotides. The closest genetic relation of amphistome T was Paramphistomidae sp. (MF678652) and Paramphistomum cervi (KU365321) with genetic distance 14.6%, while amphistome M and B had closest genetic relation with Gastrodiscoides hominis (KT777941) (genetic distance 2.3%).
Kata Kunci : Amphistomes, Gajah Sumatera, morfologi, SEM, ITS-2