Asosiasi Polimorfisme Gen Mx Exon 13 terhadap Pertumbuhan pada Ayam (Gallus gallus gallus, Linnaeus 1758) F1 Hasil Persilangan Ayam Layer Betina dan Pelung Jantan

DESIANA AFIFAH, Dr. Budi Setiadi Daryono, M. Agr. Sc.

2018 | Skripsi | S1 BIOLOGI

Salah satu upaya pemuliaan ayam untuk menghasilkan bibit ayam lokal unggul dapat dilakukan dengan seleksi sifat produktivitas (daging dan telur) dapat juga dilakukan seleksi resistensi terhadap penyakit, salah satunya adalah Avian Influenza (flu burung). Penggunaan penanda molekuler (Marker Assisted Selection) untuk persilangan terseleksi menyebabkan proses seleksi ayam lebih cepat dan akurat. Polimorfisme G/A pada nukleotida gen Mx posisi 1.892 ekson 13 dari sekuens koding menghasilkan perubahan pada asam amino 631 dari protein Mx. Substitusi Serin menjadi Asparagin mengindikasikan ayam memiliki kekebalan terhadap penyakit viral yaitu Avian Influenza. Asam amino Aspargin (alel A) pada posisi 631 spesifik terhadap Mx positif (resisten), sedangkan Serin (alel G) spesifik terhadap Mx negatif (rentan). Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui hubungan polimorfisme gen Mx ekson 13 terhadap pertumbuhan pada ayam Layer, Pelung, dan F1. Tahapan penelitian yang dilakukan yaitu pemeliharaan dan pengambilan data bobot ayam, pengambilan sampel darah, isolasi DNA, amplifikasi DNA menggunakan PCR, elektroforesis hasil PCR, dan sekuensing dengan metode Sanger. Pada pertumbuhan ayam didapatkan bahwa pertumbuhan ayam F1 Kamper jauh lebih tinggi dari Pelung namun mendekati Layer. Hasil alignment sekuens gen Mx mendapatkan 4 SNP yang terdiri dari 4 titik substitusi (A20734T, C20737T, A20766G, A20893G). Dari keempat titik polimorfisme yang didapatkan, hanya ada 1 individu ayam F1 Kamper yang menunjukkan adanya alel A posisi 631 yang spesifik terhadap Mx positif. Kesimpulan penelitian ini adalah keempat titik polimorfisme tidak berkorelasi dengan pertumbuhan ayam F1 Kamper.

The breeding of chickens to produce high quality domestic chicken, besides using productivity (meat and eggs) as selective breeding phenotype, it can also be selected by chicken's resistance to some diseases, such as Avian Influenza. The use of molecular markers (Marker Assisted Selection) for selective breeding leads to a faster and more accurate selection of chickens. The G/A polymorphism of the nucleotide position 1,892 exon 13 of coding sequence of chicken Mx gene results in a change in the amino acid 631 of MX protein. The substitution of Serine to Asparagin indicates the chickens have immunity against viral diseases include Avian Influenza. Amino Acids Aspargin (A allele) at position 631 is specific to Mx positive (resistant), whereas Serin (G allele) is specific to Mx negative (susceptible). The purpose of this research is to know the relationship of polymorphism of Mx Exon 13 on growth in Layer, Pelung, and F1 chicken. Procedures of the research were chicken maintenance, weighing, blood sampling, DNA isolation, DNA amplification using PCR, electrophoresis using agarose gel, and sequencing with Sanger method. Results of amplified Mx gene sequences alignment obtained 4 SNPs consisting 4 substitutions (A20734T, C20737T, A20766G, A20893G). From the four points of polymorphism obtained, there was only 1 F1 Kamper chicken showed the specific A ellele position 631 against Mx positive. The conclusion of this study is that the four points of polymorphism do not correlate with the growth of F1 Kamper chicken

Kata Kunci : gen Mx, pertumbuhan, Layer, Pelung / Mx gene, growth, Layer, Pelung