Identifikasi Spesies Nematoda Hirschmanniella spp. pada Akar Padi

MUHAMMAD MAULANA FARDANI A, Dr. Ir. Siwi Indarti M.P.; Alan Soffan S.P. M.Sc. Ph.D.

2018 | Skripsi | S1 PROTEKSI TANAMAN

Hirschmanniella spp. merupakan salah satu nematoda parasitik pada pertanaman padi. Gejala serangan dari Hirchmanniella spp. berupa luka pada akar tanaman sehingga akar berwarna kemerahan. Identifikasi spesies Hirschmanniella spp. di Indonesia belum pernah di lakukan. Identifikasi spesies Hirschmanniella spp. dilakukan dengan teknik molekuler dan morfologi. Identifikasi molekuler dilakukan dengan mengamplifikasi daerah 28S rRNA menggunakan primer universal nematoda ( D2A/D3B ) yang menghasilkan amplifikasi 766 bp. Analisis hasil skuensing DNA menunjukkan bahwa sampel Cangkringan merupakan spesies H. mucronata, sedangkan sampel Banguntapan dan Pleret merupakan spesies H. oryzae. H. mucronata sampel Cangkringan memiliki kemiripan tertinggi dengan sampel H. mucronata dari Belgia yakni sebesar 97,5%. H. oryzae dari Banguntapan memiliki kemiripan tertinggi dengan sampel Hirschmanniella spp. dari Vietnam, H. oryzae dari Filipina ,dan H. oryzae dari Iran yakni sebesar 99.8 %. H. oryzae dari Imogiri memiliki kemiripan tertinggi dengan sampel Hirschmanniella sp. dari Vietnam dan H. oryzae dari Filipina yakni sebesar 99.0 %. Identifikasi morfologi menunjukkan bahwa ujung ekor dari Hirschmanniella sampel Cangkringan berbentuk sangat tidak beraturan dan dengan ujung runcing kesebuah proyeksi. Sedangkan H. oryzae memiliki ujung ekor yang lebih teratur akan tetapi ujung ekor lebih menjorok ke keluar. Data identifikasi morfologi digunakan sebagai data pendukung untuk identifikasi molekuler.

Hirschmanniella spp. is one of the parasitic nematodes in the rice plantation. The indicated by Hirschmanniella spp. is infection the caused root damage red colour. The based identification are boths PCR and morphology was used to capture the species identification. Molecular identification was carried out by amplifying the area of 28S rRNA using universal nematode primer (D2A / D3B) resulting an amplifican with 766 bp. The analysis of DNA sequencing results showed that the Cangkringan sample was a H. mucronata species, while the Banguntapan and Pleret samples was H. oryzae species. The samples of H. mucronata from Cangkringan has the highest similarity with the sample H. mucronata from Belgium which was 97.5%. H. oryzae from Banguntapan has the highest similarity with Hirschmanniella sp. from Vietnam, H. oryzae from the Filipina, and H. oryzae from Iran which has 99.8% similarity. H. oryzae from Imogiri has the highest similarity with Hirschmanniella sp. from Vietnam and H. oryzae from the Filipina which was 99.0%. Morphological identification results shows that the sample of H. mucronata from Cangkringan has a very irregular shaped tail tip which forms a projection. While H. oryzae has a more regular tail tip but it is more protruding. Morphological identification data was used to support the molecular identification.

Kata Kunci : Hirschmanniella spp., H. mucronata, H. oryzae, Molecular Identification, Universal Primer (D2A / D3B), Morphological Identification.