DETEKSI MUTASI IVS I-5 (G>C) DAN IVS I-1 (G>T) GEN BETA-GLOBIN PADA PEMBAWA BETA-THALASSEMIA

GUNAWAN RAHMIL, Dr. Niken Satuti Nur Handayani, M.Sc

2018 | Tesis | MAGISTER BIOLOGI

Beta-thalassemia merupakan jenis thalassemia yang disebabkan karena adanya mutasi pada gen beta-globin yang mensintesis rantai beta-globin. Prevalensi pembawa beta-thalassemia mencapai 5-10% dari 250 juta penduduk Indonesia. Tindakan preventif untuk mengatasi jumlah penderita beta-thalassemia adalah skirining pembawa beta-thalassemia dan diagnosis molekuler untuk mendeteksi jenis mutasi penyebab beta-thalassemia. Salah satu metode yang efektif dan efisien untuk mendeteksi mutasi gen beta-globin penyebab beta-thalassemia adalah Amplification Refractory Mutation System (ARMS). Tujuan penelitian ini adalah mendeteksi mutasi IVS I-5 (G>C) dan IVS I-1 (G>T) gen beta-globin, menghitung persentase mutasi IVS I-5 (G>C) dan IVS I-1 (G>T) dan memprediksi struktur 3D beta-globin akibat kedua mutasi tersebut. DNA diisolasi dari koleksi darah yang telah teridentifikasi pembawa beta-thalassemia melalui diagnosis hematologi. Data dianalisis dengan membandingkan hasil elektroforesis produk PCR-ARMS sampel kontrol dengan sampel yang diteliti dan menghitung persentase jenis mutasi yang diperoleh. Prediksi struktur 3D beta-globin dilakukan dengan menggunakan Mega7, Clustal Omega, SWISS-MODEL Expasy dan CHIMERA. Hasil penelitian menunjukkan bahwa mutasi IVS I-5 (G>C) dan IVS I-1 (G>T) dapat dideteksi pada pembawa beta-thalassemia yang diteliti. Dari tiga puluh tiga sampel, diperoleh mutasi IVS I-5 (G>C) sebesar 36,36%, mutasi IVS I-1 (G>T) sebesar 3,03% dan sebesar 60,36% tidak terdeteksi oleh kedua jenis mutasi tersebut. Hasil prediksi struktur 3D beta-globin akibat mutasi IVS I-5 (G>C) dan IVS I-1 (G>T) menunjukkan struktur yang berbeda dengan struktur beta-globin normal.

Beta-thalassemia is a type of thalassemia caused by mutations in beta-globin gene which synthesizes beta-globin chain. The prevalence of beta-thalassemia carriers reaches 5-10% of the 250 million Indonesian population. The preventive action to overcome the number of people with beta-thalassemia is by screening carrier and molecular diagnosis to detect the mutation type causes beta-thalassemia. One of effective and efficient methods to detect mutations of beta-globin gene cause beta-thalassemia is Amplification Refractory Mutation System (ARMS). The aim of this study was to detect mutations of IVS I-5 (G>C) and IVS I-1 (G>T) of beta-globin gene, calculate the percentage of IVS I-5 (G>C) and IVS I-1 (G>T) and predict the beta-globin 3D structure as the effect of both mutations. DNA were isolated from blood collection of beta-thalassemia carriers which have been identified by hematology diagnosis. Data was analyzed by comparing electrophoresis result of PCR-ARMS product on control sample with the observed samples and calculating the percentage of the mutations. The prediction of beta-globin 3D structure were performed by Mega 7, Clustal Omega, SWISS MODEL Expasy and CHIMERA. The result showed that IVS I-5 (G>C) and IVS I-1 (G>T) mutation was successfully detected among beta-thalassemia carrier samples. From thrity three samples, IVS I-5 (G>C) mutation was found as much 36,36%, IVS I-1 (G>T) mutation 3,03%, and 60,36% was undetected. The prediction of beta-globin 3D structure due to IVS I-5 (G>C) and IVS I-1 (G>T) mutations showed the different structure compared to the normal beta-globin structure.

Kata Kunci : Beta-thalassemia, mutasi beta-globin, Amplification Refractory Mutation System (ARMS)