VARIASI GENETIK DAN KLASIFIKASI INTRASPESIES Thelymitra javanica BL. (ORCHIDACEAE: ORCHIDOIDEAE) DI GUNUNG ARJUNO, LAWU, DAN SUMBING PULAU JAWA - INDONESIA

I MADE SAKA WIJAYA, Dr. Purnomo, M.S.; Dr. Budi Setiadi Daryono, M.Agr.Sc.

2018 | Tesis | S2 Biologi

Thelymitra merupakan anggrek tanah dengan pusat distribusi di Australia dan hanya dijumpai satu spesies di Indonesia, yaitu Thelymitra javanica yang dijumpai di daerah mendekati puncak gunung pada ketinggian 2.000 sampai 3.000 m dpl. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui variasi morfologis dan molekular, hubungan kekerabatan, dan klasifikasi intraspesies T. javanica di Gunung Arjuno, Lawu, dan Sumbing, Pulau Jawa. Data morfologis diperoleh dengan metode jelajah sambil dilakukan koleksi spesimen, dokumentasi, karakterisasi morfologis, dan pengukuran parameter lingkungan. Karakter morfologis diberikan skor, kemudian dendrogram hubungan kekerabatan fenetik dikonstruksi menggunakan metode pengklasteran UPGMA dengan algoritma Percent Similarity. Data morfologis dilengkapi pula dengan analisis komponen utama. Data molekular berupa sekuens ITS-rDNA diperoleh dengan melakukan amplifikasi region ITS menggunakan primer ITS5 dan ITS4 yang disejajarkan menggunakan Clustal Omega. Konstruksi filogram hubungan kekerabatan filogenetik menggunakan metode Maximum Likelihood dengan model substitusi Kimura-2-parameter pada 500 bootstrap. Hasil penelitian menunjukkan bahwa variasi morfologi T. javanica dijumpai paling banyak pada gynostemium. Gunung Arjuno, Lawu, dan Sumbing membentuk ekotipe tersendiri berdasarkan karakter morfologisnya, namun bersifat plastis, terutama pada warna tangkai pembungaan, petal, labellum, bakal buah, dan rusuk bakal buah. Secara taksonomik, data morfologi menghasilkan 3 plastodeme. Tidak terdapat variasi molekular pada sekuens ITS-rDNA, sehingga hubungan kekerabatan filogenetik pada filogram berada dalam rangkaian politomi. Hubungan kekerabatan filogenetik tidak mendukung hubungan kekerabatan fenetik.

Thelymitra is a terrestrial orchid genera that distributed mainly in Australia and only one species that found in Indonesia, Thelymitra javanica, which growing near the peak of mountain around 2.000 to 3.000 m asl. The objectives of this study are to find out the morphological dan molecular variations, phenetic and phylogenetic relationship, and intraspecific classification of T. javanica in Mount Arjuno, Lawu, and Sumbing, Jawa. Morphological data obtained from exploration method while collecting specimen, documentation, morphological characterization, and environmental measurement. Morphological character was scored and phenetic dendrogram constructed by UPGMA clastering method with Percent Similarity algorithm and completed with Principal Component Analysis. Molecular data is a sequence od ITS-rDNA that obtained from ITS-rDNA amplification using ITS5 and ITS4 primers and alignment by Clustal Omega. Phylogram constructed by Maximum Likelihood method with substitution model Kimura-2-parameter in 500 bootstrap. The result showing the morphological variations of T. javanica mainly found in gynostemium. Mount Arjuno, Lawu, and Sumbing form its own ecotype based on plasticity morphological characters in peduncle, petal, labellum, ovary, and ovary ribs. Taxonomically, that variations forming three plastodeme that represent each mountain. There are no variation in molecular ITS-rDNA sequences, then pointing the polytomy topology in phylogram. The phylogenetic relationship did not support the phenetic relationship.

Kata Kunci : ecotype, genetic variations, plasticity,Thelymitra javanica