CLPTM1L/TERT AND CYP2E1 GENE POLYMORPHISMS AND RISK OF NASOPHARYNGEAL CARCINOMA IN YOGYAKARTA

LARASATI PUTRI A, Jajah Fachiroh, S.P., M.Si.,Ph.D ; dr. Hanggoro Tri Rinonce, Ph.D, Sp. PA ; dr. Irwan Supriyanto, Ph.D

2018 | Skripsi | S1 PENDIDIKAN DOKTER

Latar Belakang : Karsinoma NasofaringS (KNF) merupakan salah satu kanker kepala dan leher yang paling sering terjadi pada laki laki di Indonesia. KNF memiliki beberapa faktor etiologi yaitu, infeksi EBV, faktor lingkungan, dan juga faktor genetik seperti polimorfisme. Beberapa gen telah terbukti memiliki hubungan dengan resikko KNF diantaranya; CYP2E1, TLR8, XRCC1, Hogg1. Gen CLPTM1L/TERT juga terbukti meiliki hubungan dengan KNF pada subpopulasi Cina. Tujuan : Untuk menganalisa apakah kombinasi polimorfisme rs 3813865, rs 3813867, dan rs31489 akan meningkatkan resiko KNF dibandingkan dengan satu polimorfisme. Metode : Penelitian ini merupakan penelitian kasus kontrol berbasis rumah sakit, dengan jumlah sampel 150 untuk kelompok kasus dan kontrol yang menggunakan data sekunder dari hasil analisa sebelumnya. Analisa antara kombinasi dan satu polimorfisme dengan resiko KNF dilakukan menggunakan regresi logistik. Hasil: Hubungan antara satu polimorfisme dan resiko KNF pada rs 3813865 dengan genotipe homozigot wild type dan heterozigot menunjukan adanya peningkatan resiko terjadinya KNF dengan OR = 1,62 dan OR = 1,71(95%CI = 0,736 - 3,60 ; 0,768 - 3,812). Hubungan antara polimorfisme rs 3813867 dengan resiko KNF tidak dapat dilakukan karena jumlah sampel yang tidak mencukupi. Hubungan antara rs 31489 dengan resiko KNF menunjukan adanya peningkatan dengan OR = 1,39 (95% CI = 0,853 - 2,290). Hubungan kombinasi 2 polimorfisme terhadap resiko KNF dapat dilakukan dengan rs3813865 genotipe homozigot wild type dan rs31489 dengan OR = 1,42 (95% CI = 0,761 - 2,675) dan rs3813865 genotipe heterozigot mutan dan rs 31489 dengan OR = 1,185 (95% CI = 0,612 - 2,294). Proses analisa kombinasi 3 polimorfisme tidak dapat dilakukan karena jumlah sampel yang tidak mencukupi Kesimpulan: Kombinasi lebih dari 1 polimorfisme rs3813865, rs3813867 dan rs31489 tidak menunjuakan resiko lebih tinggi pada KNF dibandingkan dengan satu polimorfisme

Background: Nasopharyngeal carcinoma (NPC) is the most frequent cancer in the head and neck area and ranks as the 4th most common tumour found in males in Indonesia. NPC is caused by complex etiological factors, including /EBV infection, environmental and genetic factors such as polymorphisms. Several genes have been reported to be associated with increased risk of NPC; those who were responsible in metabolic pathway (e.g CYP2E1), immune mechanism (e.g TLR 8), DNA repair (e.g XRCC1, Hogg1), and cell cycle. CLPTM1L/TERT also reported to be associated with NPC in two Chinese subpopulations. Objective: To analyze whether combination of rs 3813865, rs 3813867, and rs 31489 polymorphism will increased the risk of Nasopharyngeal Carcinoma compared to those with single polymorphism Method: This research is nested hospital based case control study, with 150 patients in each case and control groups that used secondary data from previous analysis. The association between single and combination polymorphisms of rs3813865, rs3813867, rs31489 with risk of NPC was analyzed using logistic regression. Results: . Association between single polymorphism and risk of NPC, rs 3813865 heterozygouse mutant and homozygouse wild type genotype shows increased risk of NPC with OR = 1.62 and OR = 1.71 respectively (95%CI = 0.736 - 3.60 ; 0.768 - 3.812). While for the rs 3813867 the association between this polymorphism and risk of NPC can not be analyzed due to inadequate number of sample. In rs 31489 heterozygouse mutant genotype shows increased risk of NPC with OR = 1,39 (95% CI = 0.853 - 2.290). Association between heterozygouse mutant of rs 3813865 and rs 31489 shows an increase risk of NPC with OR = 1,42 (95% CI = 0.761 - 2.675). While the combination between homozygouse wild type of rs 3813865 and heterozygouse mutant genotype of rs 31489 shows and increase risk with OR = 1.18 (95% CI = 0.612 - 2.294). Combination of 3 polymorphism could not be performed due to inadequate number of sample Conclusion: Combination of more than 1 polymorphisms of rs 3813865, rs 381387 and rs 31489 did not show higher risk towards NPC compared to single polymorphism.

Kata Kunci : NPC, polymorphism, CLPTM1L/TERT, CYP2E1