ANALISIS KANDUNGAN DAGING TIKUS DALAM BAKSO MENGGUNAKAN METODE POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR) PRIMER SPESIFIK GEN ND1 DNA MITOKONDRIA; ANALYSIS OF RAT MEAT CONTENT IN MEATBALLS BY USING POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR) SPECIFIC PRIMER ND1 GENE MITOCHONDRIAL DNA

Fadillah Putri Patria, Tri Joko Raharjo

2014 | Skripsi | Program Studi S1 Kimia

Telah dilakukan penelitian mengenai analisis kandungan daging tikus dalam bakso menggunakan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) primer spesifik gen ND1 DNA mitokondria. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan metode deteksi cemaran daging tikus pada bakso berbasis uji DNA. Penelitian ini meliputi dua tahap yaitu unjuk kerja metode PCR berupa uji spesifikasi, penentuan batas deteksi dan aplikasi metode untuk uji bakso yang dijual di pasar. Ekstraksi DNA dilakukan dengan metode fenol-KIAA kemudian dianalisis dengan elektroforesis dan spektrofotometri UV. Isolat DNA digunakan sebagai cetakan dalam proses amplifikasi dengan menggunakan primer spesifik dari gen ND1, yaitu primer forward (5’- CGG CAT CCT ACA ACC ATT TGC-3’) dan primer reverse (5’-CGG CTC GTA AAG CTC CGA A-3’). Tahap-tahap tersebut dilakukan baik dalam uji spesifitas, penentuan batas deteksi maupun aplikasi metode. Hasil amplifikasi PCR terhadap isolat DNA dari bakso menghasilkan fragmen dengan panjang 278 pb. Unjuk kerja metode yang dilakukan menunjukan bahwa metode ini spesifik digunakan untuk mendeteksi cemaran daging tikus dalam bakso tikus dengan batas deteksi hingga konsentrasi 5% (b/b). Enam sampel bakso yang dijual di warung, supermarket, dan pasar tradisional tidak menunjukkan adanya kontaminasi daging tikus.

Kata Kunci : Polymerase Chain Reaction, Daging Tikus, Bakso, Analisis Halal