PENGEMBANGAN METODE MULTIPLEKS PCR GEN MT-12S rRNA UNTUK MENDETEKSI CEMARAN DAGING BABI PADA PRODUK OLAHAN ASAL DAGING SAPI

SITOMPUL, Yeremia Yobelanno l, Sidna Artanto

2014 | Skripsi |

Pencampuran daging babi pada produk olahan asal daging sapi masih sering terjadi dan meresahkan masyarakat Indonesia, terutama yang beragama Islam. Multipleks Polymerase Chain Reaction (Multipleks PCR) merupakan salah satu metode berbasis DNA yang dapat diaplikasikan untuk uji deteksi cemaran daging babi pada produk olahan asal daging sapi. Multipleks PCR merupakan perkembangan dari metode PCR untuk mengamplifikasi beberapa daerah target dalam satu reaksi yang menggunakan lebih dari satu macam primer. Penelitian ini bertujuan untuk mendesain dan mengaplikasikan primer spesifik berdasarkan gen mt-12s rRNA sapi dan babi untuk mendeteksi cemaran daging babi pada produk olahan daging sapi menggunakan metode Multipleks PCR. Primer didesain secara in silico menggunakan perangkat lunak bioinformatika MegAlign dan AmplifX. Kemampuan primer hasil pendesainan dalam mengamplifikasi DNA target secara spesifik diuji dengan mengamplifikasi DNA hasil isolasi yang berasal dari daging mentah dan produk olahan asal daging sapi, yaitu bakso sebanyak dua belas sampel. Amplikon yang terbentuk dari DNA sapi dan babi secara spesifik berukuran 91 bp dan 230 bp. Hasil amplifikasi DNA dari daging mentah dan bakso sapi yang mengandung daging babi menunjukkan primer hasil pendesainan dapat mendeteksi campuran daging babi pada daging mentah dan bakso sapi. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa gen mt-12s rRNA dapat dijadikan dasar pendesainan primer dalam metode Multipleks PCR untuk mendeteksi cemaran daging babi.

The adulteration of pork in beef products is still being done that cause fidgetiness among people, especially Muslim. Multiplex Polymerase Chain Reaction (Multiplex PCR) is a method based on DNA that can be used to detect the adulteration of pork in beef products. Multiplex PCR is the development of PCR method that capable to amplify template mixture in single step reaction by using multiple primers. The purpose of this study was to design specific primers based on mt-12s rRNA gene of cow and pig to detect the adulteration of pork in beef products by Multiplex PCR method. Primers were designed by in silico method using bioinformatic tools. The ability of designed primers to amplify templates specifically was tested by amplifying isolated DNA from raw beef and pork and twelve samples of their products, namely meatballs. The length of amplified fragment for cow and pig were 91 bp and 230 bp respectively. The result of amplification of isolated DNA from raw beef and beef meatballs that contain pork showed designed primers can detect the presence of pork in samples. Based on this result, the designed primers can be used to detect adulteration of pork or rat in Multiplex PCR method.

Kata Kunci : Multipleks PCR, daging sapi, daging babi, mt-12s rRNA