Kajian Keragaman Genetik Gen Penyandi Cytochrome Oxidase Sub-unit2 (COX2) pada Tarsiusbanc anus borneanus,Tarsiusspectrum dan Tarsiusdianae
SAPUTRA, Dandy Satria, Rini Widayanti
2012 | Skripsi |IndonesiadikenalsebagainegaradengankeanekaragamanhayatiterbesardiduniasetelahBrazil.Keanekaragamanhayatiinimeliputikeanekaragamanfloradanfauna.Keanekaragamanfauna,khususnyaprimata,dalambeberapadekadeterakhirmengalamipenurunanjumlah,bahkanbeberapaspesiesterancampunah.SalahsatuprimataendemikasliIndonesiayangterancampunahadalahTarsiussp.Olehkarenaitu,diperlukanusahakonservasiuntukmenjagakelestariannya.InformasitentangperbedaaankarakterikstiktiapspesiesdiharapkandapatmembantuusahakonservasidanpengembalianTarsiussp.kehabitatasli.TujuanutamapenelitianiniadalahuntukmempelajarikeragamangenetikpadaTarsiusbancanusborneanus,TarsiusspectrumdanTarsiusdianaeberdasarkansekuengenpenyandiCytochromeOxidaseSub-unitII(COX2)sebagaidasarklasifikasidalamusahakonservasi. A mplifikasisegmengenCOX2menggunakanDNAhasilisolasiuntukcetakan,primerCOX2ForwarddanprimerCOX2Reverse.AmplifikasidenganteknikPolymeraseChainReaction(PCR)menghasilkanproduksepanjang657bp,selanjutyadilakukanprosessekuensing.HasilsekuensinggenCOX2yangdidapatkemudiandibandingkandenganprimatalainyangdiambildariGenbank.Ha silpenelitianmenunjukkanadakeragamangenetikantaraspesiesTarsiusbancanusborneanus,TarsiusspectrumdanTarsiusdianae.Haliniditunjukkanjarakgenetikberdasarsekuennukleotidadanasamaminosebesar0,3%dan0,4%.TarsiusbancanusborneanusdanTarsiusdianaedapatdibedakandenganTarsiusspectrummenggunakansekuennukleotidaurutanke-634dan640sertaposisiasamaminopadasituske-212.Kata kunci:Tarsiusbancanusborneanus,Tarsiusspectrum,Tarsiusdianae,genCOX2,sekuenDNA
IndonesiaknownasthecountrieswiththebiggestbiodiversityintheworldafterBrazil.Thebiodiversityincludeddiversityoffloraandfauna.Thediversityoffauna,especiallyprimates,inrecentdecadeshasdecreasedthenumberofpopulationandsomespeciesevenendangered.OneofIndonesianendemicprimateswasendangeredisTarsiussp.Therefore,conservationeffortsareneededtopreservetheTarsiussp.InformationaboutthedifferencecharacteristicseachspeciesisexpectedtohelpeffortstoconserveandrestoreTarsiussp.totheoriginalhabitat.ThemainobjectiveofthisresearchwastostudythegeneticdiversityinTarsiusbancanusborneanus,TarsiusspectrumandTarsiusdianaebasedonthesequenceofthegenecodingforcytochromeoxidasesub-unitII(COX2)asabasicforclassificationinconservationefforts. Am plificationofCOX2genebyPCRusedtheresultofDNAisolation,primerCOX2forwardandprimerCOX2reverse.ThePCRtechniqueproduced657bpDNAsegmentwhichhasfollowedbysequencing.TheresultofCOX2genesequencesthenmultiplealignedwithotherprimateswhicharetakenfromGenbank.The resultsshowedtherewasnogeneticdiversitybetweenTarsiusbancanusborneanus,TarsiusspectrumandTarsiusdianae.Thisshownbyageneticdistanceofnucleotideandaminoacidsequences0.3%and0.4%.TarsiusbancanusborneanusandTarsiusdianaecanbedistinguishedwithTarsiusspectrumbyusingasequenceofnucleotidesite-634thandsite-640thaswellasaminoacidpositionsite-212th.Keyword s:Tarsiusbancanusborneanus,Tarsiusspectrum,TarsiusdianaeCOX2gene,DNAsequence
Kata Kunci : Tarsiusbancanusborneanus, Tarsiusspectrum, Tarsiusdianae, genCOX2, sekuen DNA