FENOTIPE DAN GENOTIPE Edwardsiella tarda ISOLAT DARI IKAN AIR TAWAR DI ACEH

WARDANI, DIAN KUSUMA , Kurniasih

2015 | Tesis |

Edwarsiella tarda merupakan jenis bakteri yang termasuk salah satu Hama Penyakit Ikan Karantina (HPIK) golongan II yang diartikan sebagai jenis penyakit yang sudah ada di Indonesia. Penyakit ini belum ada tekhnologi untuk penanggulangannya. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui : 1). Identifikasi fenotipe E. tarda pada ikan tawar di Aceh, 2). Identifikasi genotipe E. tarda pada ikan air tawar di Aceh, 3). Antibiotika yang efektif untuk pengobatan infeksi Edwardsiella tarda pada ikan air tawar di Aceh, 4). Patogenesis E. tarda pada ikan air tawar di Aceh. Empat isolat E. tarda diperoleh dari ikan nila dan ikan lele, dilakukan isolasi dan identifikasi bakteriologik. Dilakukan uji molekuler dengan mengekstraksi semua isolat E. tarda, diamplifikasi gen rRNA pada SSU-16S. Dilakukan proses revirulensi 4 isolat pada ikan nila. Uji sensitifitas antibiotik menggunakan antibiotika Enrofloxacin (ENR), Eritromicin (E), Gentamicin (CN), dan Ampicilin (AMP) pada media Mueller Hinton Agar (MHA) terhadap bakteri E. tarda. Uji patogenesitas dilakukan pada ikan nila sehat yang diinfeksi dengan isolat E.tarda 10 6 sel/ ml disuntikkan secara intra peritonial sebanyak 0,1 ml. Pengamatan makroskopik dan histopatologi pada hari ke 4 dan 8 post infeksi.. Hasil identifikasi fenotipe dari 4 isolat E.tarda sama dengan isolat E.tarda yang berasal dari Yogyakarta dan Semarang sebagai pembanding. Hasil sequencing E. tarda pada gen rRNA SSU-16S tidak sesuai dengan hasil identifikasi morfologi. Hasil uji sensitifitas bakteri E. tarda terhadap antibiotik Enrofloxacin lebih sensitif dibanding antibiotik Eritromisin, Gentamicin, dan Ampicilin. Perubahan histopatologis pada hari ke 4 post infeksi menunjukkan dermatitits, nephritis, meningitis, dan erosi usus. Perubahan meluas ke organ limpa pada hari ke 8.

Edwarsiella tarda is a type of bacteria which includes one of the Fish Quarantine Pests (HPIK) class II which is defined as a type of disease that already exist in Indonesia, but there is no technology to overcome. This study aims to determine: 1). Fenotype E. tarda in freshwater fish in Aceh, 2). Genotype E. tarda in freshwater fish in Aceh, 3). Antibiotics are effective for the treatment of E. tarda in freshwater fish in Aceh, 4). E. tarda pathogenesis of isolates of freshwater fish in Aceh Four isolates of E. tarda derived from fish Tilapia and Catfish. Molecular testing is done by extracting all isolates of E. tarda, amplified 16S rRNA on-SSU 16S. Antibiotic sensitivity test antibiotic use Enrofloxacin (ENR), Erythromycin (E), Gentamicin (CN), and Amphicilin (AMP) on Mueller Hinton media Agar (MHA) against bacteria E. tarda. Revirulensi of 4 isolates processes on tilapia. Pathogenesis test performed on healthy tilapia infected with isolates E.tarda 10 6 cells / ml injected intra peritonial 0.1 ml. Macroscopic and histopathological observations on days 4 and 8 post-infection. The results of the isolation and identification of 4 isolates E.tarda equal to isolate E. tarda from Yogyakarta and Semarang. Molecular test results showed that DNA of E.tarda has a large 1041 bp. The test results of bacterial sensitivity to antibiotics Enrofloxacin E.tarda more sensitive than the antibiotic Erythromycin, Gentamicin, and Ampicilin. Skin tissue lesions appear at day 4 post-infection and spread to the lymph organs at day 8 post-infection.

Kata Kunci : Fenotipe, Genotipe, Patogenesitas, Edwardsiella tarda