IDENTIFIKASI KERAGAMAN GENETIK SAPI KETURUNAN BRAHMAN BERDASARKAN MARKER GEN INSULIN-LIKE GROWTH FACTOR BINDING PROTEIN-3 DAN PENGARUHNYA TERHADAP SIFAT PERTUMBUHAN PRASAPIH

DWI AHMAD PRIYADI, Tety Hartatik, S.Pt., Ph.D., Panjono, S. Pt., M.P., Ph.D.

2017 | Tesis | S2 Ilmu Peternakan

Insulin-like growth factor binding protein-3 (IGFBP-3) mengikat insulin-like growth factor-1 (IGF-1) dengan afinitas yang kuat sehingga mengatur fungsi biologisnya yang menstimulus pertumbuhan, pembelahan, diferensiasi, dan daya hidup sel. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman genetik pada sapi Brahman, Brahman Cross (BX), persilangan antara Wagyu dengan BX, dan persilangan Belgian Blue (BB) dengan BX menggunakan marker genetik pada gen IGFBP-3, serta untuk mengetahui hubungan keragaman genetik tersebut dengan sifat pertumbuhan prasapih. Penelitian ini dilakukan di PT. Widodo Makmur Perkasa, Klaten, Jawa Tengah. Materi yang digunakan ialah 10 ekor sa-pi Brahman, 33 ekor induk betina sapi BX, 16 ekor pedet sapi BX, 8 ekor pedet hasil persilangan Wagyu-BX, dan 9 ekor sapi hasil persilangan BB-BX. Data yang diambil meliputi sifat pertumbuhan (bobot badan, panjang badan, tinggi gumba, lingkar dada) umur lahir, 90 hari, dan 180 hari. Sampel darah dari keseluruhan sapi dikoleksi sebagai sumber materi genetik yang akan ditentukan genotipnya menggunakan metode sequencing atau PCR-RFLP. Data yang diperoleh diana-lisis menggunakan uji One-Way Anova, dan digunakan uji lanjut Tukey�s, khusus untuk data PBBH, dilakukan analisis Kovariansi dengan bobot awal sebagai kovariat. Hasil penelitian menunjukkan adanya pengaruh bangsa terhadap keseluruhan sifat pertumbuhan lahir, PB dan TG umur 90 hari, TG dan LD umur 180 hari, dan PBBH 90 sampai 180 hari. Marker gen (SNP) ditemukan di tiga lo-kasi pada gen IGFBP-3 563 bp pada posisi basa nukleotida nomor 3.930 A/G, 3.996 A/C, dan 4.177 A/G. Posisi SNP tersebut dapat dikenali menggunakan enzim restriksi secara berurutan yaitu PvuII, HaeIII, dan NlaIII. Interaksi ketiga SNP tersebut menghasilkan empat genotip. Terdapat hubungan yang signifikan antara SNP-3.930 A/G pada sapi BB-BX dengan LD umur 90 hari dan TG dan LD umur 180 hari. Single nucleotide polymorphism-3.930 A/G yang ditemukan pada gen IGFBP-3, diindikasikan dapat digunakan sebagai marker genetik terkait sifat pertumbuhan sapi.

Insulin-like growth factor binding protein-3 (IGFBP-3) binds insulin-like growth factor-1 (IGF-1) with a high affinity that regulates its biological functions that stimulate growth, division, differentiation, and vitality of the cell. The aim of this study is to identify genetic diversity in Brahman, Brahman Cross (BX), Wagyu crosses with BX, and Belgian Blue (BB) crosses with BX using IGFBP-3 gene as a genetic marker, as well as to identify the genetic variation of pre-weaning growth. This research was conducted at PT. Widodo Makmur Perkasa, Klaten, Central Java. The materials used were 10 Brahman cows, 33 BX cows, 16 BX calves, 8 crosses of Wagyu-BX calves, and 9 crosses of BB-BX calves. The data collected include the growth traits (body weight, body length (BL), wither height (WH), heart girth (HG)) of birth, 90-day, and 180-day old. The blood samples from the whole cattle were collected as genetic material sources to be determined gen-otypically using sequencing or PCR-RFLP methods. The data obtained were ana-lyzed using One-Way Anova test, and Tukey's post-hoc test, specifically for ADG data, performed Covariance analysis with initial weight as the covariate. The re-sult showed the breed influence on the overall trait of birth, BL and WH 90-day old, WH and HG 180-day old, and ADG 90 to 180-day old. The gene markers (SNP) were found at three sites at nucleotide base number 3,930 G/A, 3,996 A/C and 4,177 A/G. The position of the SNP can be identified using restriction en-zymes PvuII, HaeIII and NlaIII, respectively. The interaction of the SNPs produc-es four genotypes. There were a significant relationship between SNP-3.930 A/G in BB-BX cattle with HG at 90-day old and WH and HG at 180-day old. The SNP-3,930 at IGFBP-3 gene is indicated to be used as a genetic marker of cattle growth traits.

Kata Kunci : marker gen, IGFBP-3, Brahman, Brahman Cross, Belgian Blue, Wagyu, sifat pertumbuhan