VARIASI DNA MIKROSATELIT JABON MERAH (Anthocephalus macrophylus (Roxb.) Havil) PADA AREAL KONSERVASI SUMBERDAYA GENETIK DI SULAWESI SELATAN

ANDRIANI W., Dr. Sapto Indrioko, S.Hut, MP; Dr. Ir. Eny Faridah, M.Sc

2017 | Tesis | S2 Ilmu Kehutanan

Variasi DNA Mikrosatelit Pada Jabon Merah (Antocephallus macrophyllus Roxb. Havil) Pada Areal Konservasi Sumberdaya Genetik di Sulawesi Selatan INTISARI Jabon merah (Anthocephalus macrophyllus Roxb. Havil) adalah salah satu jenis tanaman endemik Indonesia yang potensial untuk dikembangkan. Persebarannya yang terbatas di Pulau Sulawesi dan Maluku dengan potensi kemanfaatannya yang luas membuat suatu kekhawatiran makin menyempitnya keragaman genetik jabon merah di populasi asalnya. Salah satu pendekatan untuk mengetahui informasi keragaman genetik populasi adalah dengan menggunakan penanda mikrosatelit. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan sekuens primer unik untuk analisis mikrosatelit jabon merah dan untuk mengetahui keragaman genetik pada Areal Konservasi Sumberdaya Genetik (AKSDG) jabon merah di Sulawesi Selatan. Penelitian dilakukan dengan mengambil sampel berupa daun juvenil jabon merah yang diambil secara acak dari 9 populasi jabon merah yang berada dalam areal konservasi sumber daya genetik jabon merah di Sulawesi Selatan. Total individu jabon merah yang dianalisis adalah sebanyak 256 individu, terdiri dari 40 individu sampel berasal dari populasi Uepai, 40 individu dari populasi Napabalano, 40 individu dari populasi Pasir Putih, 40 individu dari populasi Kapuntori, 40 individu dari populasi Manado, 25 individu dari populasi Bonegunu, 11 individu dari populasi Batui Selatan, 10 individu dari populasi Pituriase, dan 10 individu dari populasi Kasing Tuwu. 13 pasang primer yang diamplifikasi terhadap spesies jabon merah pada penelitian ini ditemukan tiga pasang primer polimorfik yaitu primer M47, NCAC15 dan NCAC11. Untuk parameter keragaman genetik dalam populasi, diketahui rerata lokus polimorfik sebesar 100%, dengan rerata jumlah alel per lokus 3,18 dan rerata alel efektif 2,368. Untuk parameter keragaman genetik dalam populasi, diketahui rerata lokus polimorfik sebesar 100%, dengan rerata jumlah alel per lokus 3,18 dan rerata alel efektif 2,368. Untuk heterozigositas harapan (HS) dalam populasi diperoleh nilai 0,580 dengan rerata heterozigositas teramati (HO) sebesar 0,210 dan rerata koefisien inbreeding sebesar 0,642. Pada pengamatan parameter keragaman genetik antar tegakan diperoleh nilai DST = 0,053 dan GST = 0,083 sedangkan heterozigositas harapan total sembilan populasi jabon merah yang diobservasi (HT) sebesar 0,632. Presentase hidup jabon merah di Kab. Gowa adalah sebesar 69,38% dengan rata-rata tinggi sebesar 48,22 cm. Sedangkan presentase hidup jabon merah di Kab. Pangkep adalah sebesar 2,24% dan rata-rata tinggi tanaman sebesar 32,68 cm.

DNA Microsatellite Variation In Red Jabon (Antocephallus macrophyllus Roxb. Havil) On Genetic Conservation Area of South Sulawesi ABSTRACT Red jabon (Anthocephalus macrophyllus Roxb. Havil) is one of endemic plant of Indonesia that potential to be developed. Red jabon has a high potential usefullnes. In Indonesia, red jabon natives population spread only in Cellebes and Maluku Island. Information about genetic diversity of red jabon not found yet before. Microsatellite often used to find out information about it. This research aims to find unique primer sequence that will be used in microsatellite analysis in red jabon species and also to analyzed its genetic diversity on Genetic Conversation Area at South Sulawesi. Research was conducted by using samples taken from nine population of red jabon inside genetic conservation area in South Sulawesi. Sample materials were juvenile leaves that collected randomly from each stand. There are 256 samples taken in this research. 40 samples taken from Uepai population, 40 samples taken from Napabalano population, 40 samples taken from Pasir Putih population, 40 samples taken from Kapuntori population, 40 40 samples taken from Manado population, 25 samples taken from Bonegunu population, 11 samples taken from Batui Selatan population, 10 samples taken from Pituriase population, 10 samples taken from Kasing Tuwu population. In this research, 13 pairs of primer amplificated on red jabon and found that 3 of them are polymorphic i.e. M47, NCAC15, and NCAC11 The results showed that for genetic diversity within stands, the mean of polymorphic loci was 100%, with a mean number of alleles per locus 3,18, and mean of effective alleles was 2,368. The expected heterozygosity within stands (HS) was 0,580. With the observed heterozygosity (HO) of 0,210 while the mean of inbreeding coeffient was 0,642. On genetic diversity among stands, DST and GST values were 0,053 and 0,083 respectively, while total expected heterozygosity of the three stands (HT) was 0,632. The genetic diversity of the jabon population in AKSDG South Sulawesi is more distributed within the population of 91.69%, compared to the distribution among the population (8.31 %%). The percentage of live red jabon species in genetic conservation area of South Sulawesi at Kab. Gowa was 69,38% with the mean of height 48,22 cm. The percentage of live red jabon species in genetic conservation area of South Sulawesi at Kab. Pangkep was 2,24% with the mean of height 32,68 cm.

Kata Kunci : jabon merah, konservasi sumber daya genetik, mikrosatelit, dna, keragaman genetik/red jabon, genetic conservation, microsatellite, dna, genetic diversity