Karakteristik Morfologi dan Molekuler Layur (Trichiurus spp.) di Perairan Selatan Yogyakarta

HANAN FAHMI LARASATI, Dr. Eko Setyobudi, S.Pi., M.Si. ; Ir. Murwantoko, M.Si.

2017 | Skripsi | S1 MANAJEMEN SUMBER DAYA PERIKANAN

Ikan layur merupakan salah satu sumberdaya perikanan komoditas ekspor yang tersebar luas. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies ikan layur (Trichiurus spp.) yang tertangkap di perairan selatan Yogyakarta secara morfologi dan molekuler berdasarkan sekuen 16S rRNA. Ikan layur diambil dari hasil tangkapan nelayan Sadeng, Depok dan Congot pada bulan Februari sampai November 2016. Identifikasi secara morfologi dilakukan dengan pengukuran 22 karakter morfometrik dan 4 karakter meristik. Analisis data morfometrik menggunakan Principal Component Analysis dan Discriminant Analysis, sedangkan data meristik dibandingkan dengan pustaka. Identifikasi secara molekuler dilakukan dengan isolasi DNA, kemudian amplifikasi dan sekuensing gen 16S rRNA. Hasil penelitian menunjukkan bahwa berdasarkan karakter morfologi dan molekuler spesies ikan layur yang ditemukan adalah Trichiurus lepturus. Spesies T. lepturus dari Perairan Gunung Kidul membentuk kelompok populasi yang terpisah dari spesies T. lepturus dari Perairan Bantul dan Kulon Progo, namun spesies T. lepturus dari Perairan Bantul berhubungan dekat dengan spesies T. lepturus dari Perairan Kulon Progo. Karakter pembeda antar populasi yaitu karakter dermal eye opening dan body depth at anus. Analisis filogenetik menunjukkan T. lepturus Perairan Gunung Kidul membentuk clade yang terpisah dari T. lepturus Perairan Bantul dan Kulon Progo.

Hairtails was one of the fishery resources of export commodities which widely distributed. The aims of study were to identify the species of hairtails (Trichiurus spp.) caught in the southern waters of Yogyakarta based on morphological and molecular of 16S rRNA sequence. Fishes were collected by fisherman in Sadeng, Depok and Congot on February to November 2016. The morphological identification was conducted using 22 morphometric measurements and 4 meristic characters. Morphometric data were analyzed using Principal Component Analysis and Discriminant Analysis, while meristic data were compared with refferences. Molecular identification was done by DNA isolation, then amplification and sequencing of the genes 16S rRNA. Based on the morphological and molecular characters, the result showed that the species of hairtails is Trichiurus lepturus. The T. lepturus species from Gunung Kidul waters made separate population group of T. lepturus species from Bantul and Kulon Progo waters, but the T. lepturus species in Bantul waters were closely related to the T. lepturus species in Kulon Progo waters. Character which distinguished between populations were dermal eye opening character and body depth at anus. Phylogenetic analysis showed that T. lepturus Gunung Kidul waters made separate clade from T. lepturus Bantul and Kulon Progo waters.

Kata Kunci : 16S rRNA, ikan layur, meristik, molekuler, morfometrik, T. lepturus