KAJIAN INTERAKSI SENYAWA KURKUMIN DAN ANALOG KURKUMIN DENGAN RESEPTOR DIPEPTIDYL PEPTIDASE-4 (DPP-4) MENGGUNAKAN METODE DOCKING DAN DINAMIKA MOLEKULER

ERVAN SEJATI, Dr. Winarto Haryadi, M. Si; Prof. Dr. Harno Dwi Pranowo, M. Si

2016 | Tesis | S2 Ilmu Kimia

Kajian interaksi senyawa kurkumin dan analog kurkumin dengan reseptor dipeptidyl peptidase-4 menggunakan metode docking molekuler telah dilakukan. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk untuk menentukan senyawa analog kurkumin yang mempunyai potensi sebagai inhibitor dipeptidyl peptidase-4 secara docking molekul dan dinamika molekuler. Penelitian ini diawali dengan docking senyawa kurkumin pada DPP-4 dan dilanjutkan dengan analog kurkumin. Berdasarkan docking molekuler, diperoleh nilai binding site dari masing-masing senyawa. Selanjutnya hasil docking dari analog kurkumin dibandingkan dengan hasil docking dari kurkumin untuk mengetahui senyawa terbaik. Docking molekuler kurkumin menghasilkan nilai energi bebas Gibbs ikatan -8,4 kkal/mol sedangkan analog kurkumin mempunyai nilai energi bebas Gibbs ikatan antara -7,5 kkal/mol sampai -8,4 kkal/mol. Salah satu analog kurkumin mempunyai nilai yang sama dengan kurkumin. Bahkan hasil uji aktivitas analog kurkumin tersebut lebih aktif dari kurkumin, sehingga analog tersebut sangat berpotensi untuk dijadikan senyawa obat antidiabetes baru.

Study on interaction of curcumin and curcumin analogues with dipeptidyl peptidase-4 receptor using molecular docking has been performed. The purpose of this study is to determine curcumin analog compounds that have potential as inhibitors of dipeptidyl peptidase-4 in docking and molecular dynamics. This work was started with docking of curcumin compound in dipeptidyl peptidase-4 and continued with curcumin analogues. Based on docking molecular, the value of binding affinity of each compound was obtained. The next procedure was to compare the result to find the best compound. The free energy Gibbs binding result from molecular docking of curcumin was -8.4 kcal/mol whereas curcumin analogues had free energy Gibbs binding with range values from -7.5 kcal/mol to 8.4 kcal/mol. One of the curcumin analogues had the same free energy Gibbs binding value as curcumin. In fact, it had better activity than curcumin hence it had potency to be the new precursor compound for drug development.

Kata Kunci : kurkumin, docking molekuler, analog kurkumin, DPP-4, curcumin, molecular docking, curcumin analogues, DPP-4