ESTIMASI PARAMETER GENETIK SIFAT PERTUMBUHAN DAN IDENTIFIKASI GEN MC4R SAPI PERANAKAN ONGOLE DI KABUPATEN KEBUMEN JAWA TENGAH

AKHMAD FATHONI, Prof. Dr. Ir. Sumadi, M.S.; Dyah Maharani, S.Pt., M.P., Ph.D.

2016 | Tesis | S2 Ilmu Peternakan

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman genetik melalui estimasi parameter genetik sifat pertumbuhan ternak di Kabupaten Kebumen meliputi heritabilitas, ripitabilitas, korelasi genetik, nilai pemuliaan, dan Most Probable Producing Ability (MPPA) serta untuk mengidentifikasi gen MC4R pada sapi Peranakan Ongole (PO) Kebumen. Penelitian terdiri dari dua tahapan, yaitu 1) pengumpulan data recording dan pengambilan sampel darah di Kabupaten Kebumen, 2) perhitungan parameter genetik dan analisis molekuler gen MC4R untuk mengetahui polimorfisme gen MC4R dengan sifat pertumbuhan dilakukan di Laboratorium Genetika dan Pemuliaan Ternak. Penelitian ini dilaksanakan dari bulan Agustus sampai dengan Desember 2015 di Wilayah Urut Sewu Kabupaten Kebumen serta di Laboratorium Genetika dan Pemulian Ternak Fakultas Peternakan UGM. Materi penelitian yang digunakan yaitu data recording ternak tahun 2013 sampai 2015 sebanyak 1133 data dan 60 sampel darah sapi PO Kebumen. Data pertumbuhan ternak seperti berat lahir (BL), berat sapih, ukuran tubuh meliputi panjang badan lahir (PBL), lingkar dada lahir (LDL), tinggi gumba lahir (TGL), panjang badan sapih (PBS), lingkar dada sapih (LDS), tinggi gumba sapih (TGS) dan ADG dikoreksi berdasarkan jenis kelamin dan umur induk. Berat sapih dikoreksi ke dalam umur penyapihan 120 hari. Hasil yang didapatkan yaitu nilai heritabilitas sifat pertumbuhan sapi PO Kebumen termasuk semua dalam kategori tinggi (BL 0.76±0.12, BS 0.36±0.21, PBL 0.76±0.12, LDL 0.80±0.13, TGL 0.76±0.13, PBS 0.32±0.21, LDS 0.40±0.22, TGS 0.40±0.21 dan ADG 0.40±0.23). Nilai ripitabilitas sifat pertumbuhan sapi PO termasuk dalam kategori sedang (PBL 0.21±0.10, TPL 0.30±0.10, PBS 0.27±0.10, LDS 0.19±0.15) dan tinggi (BL 0.33±0.10, BS 0.32±0.15, LDL 0.31±0.10, dan TPS 0.31±0.14). Nilai korelasi genetik sifat pertumbuhan sapi PO Kebumen termasuk dalam kategori tinggi (BL-BS 0.42±0.67, BL-PBL 0.76±0.64, BL-LDL 0.71±0.65, BL-TPL 0.75±0.64, BST-PBS 0.63±0.61, BS-TGS 0.36±0.68) dan sedang (BS-LDS 0.21±0.69). Hasil analisis gen MC4R menunjukkan terdapat perbedaan yang nyata antara panjang badan saat lahir dan genotip sapi PO Kebumen berdasarkan berdasarkan gen MC4R dengan SNP g.1133 C>G. Berdasarkan hasil penelitian ini dapat disimpulkan bahwa estimasi parameter genetik untuk sifat pertumbuhan sapi PO yang diteliti di Kebumen termasuk kategori sedang dan tinggi. Marker SNP 1133 g. C>G dapat direkomendasikan sebagai alat seleksi ternak dengan sifat unggulan yaitu panjang badan saat lahir.

The objective of this study was to determine the genetic diversity by estimating genetic parameters (heritability, repeatability, genetic correlation, breeding value and most probable producing ability) of growth traits in Kebumen and identify the MC4R gene in Kebumen Ongole crossbred cattle. The research was conducted from August to December 2015 in Urut Sewu, Kebumen and in the Laboratory of Genetics and Animal Breeding Faculty of Animal Science, Universitas Gadjah Mada. This study was divided into two phases: in the field and laboratory study. Growth data such as birth weight (BW), weaning weight (WW), birth body length (BBL), birth chest circumference (BCC), birth shoulder height (BSH), weaning body length (WBL), weaning chest circumference (WCC) and weaning shoulder height (WSH) were corrected base on sex and age of the dams. Weaning weight was corrected into the weaning age of 120 days. One thousand one hundred thirty three of recording data from 2013 to 2015 for growth traits were collected. These data were used for estimating genetic parameters. Sixty of them were collected for blood sample.The results of heritability estimation values were all in high category (BW 0.76±0.12, WW 0.36±0.21, BBL 0.76±0.12, BCC 0.80±0.13, BSH 0.76±0.13, WBL 0.32±0.21, WCC 0.40±0.22, WSH 0.40±0.21 and ADG 0.40±0.23). Repeatability values were in medium and high category (BW 0.33±0.10, WW 0.32±0.15, BBL 0.21±0.10, BCC 0.31±0.10, BSH 0.30±0.10, WBL 0.27±0.10, WCC 0.19±0.15 and WSH 0.31±0.14). The genetic correlations value also were medium and high category (BW-WW 0.42±0.67, BW-BBL 0.76±0.64, BW-BCC 0.71± 0.65, BW-BSH 0.75 ± 0.64, WW-WBL 0.63 ± 0.61, WW-WCC 0.70±0.65, WW-WSH 0.36± 0.68). The results of association between polimorphism gene and growth traits showed that there were significantly difference between body length at birth and the genotype of cattle based on the MC4R gene with SNP g.1133 C>G (P <0,05). Based on the results of this research, it can be concluded that the genetic parameter estimation for the growth traits of Ongole crossbreed cattle in Kebumen include medium and high categories. The SNP marker of 1133 g. C>G can be recommended as a means of selection of livestock with superior trait especially length at birth.

Kata Kunci : Parameter Genetik, Peranakan Ongole, Gen MC4R, Sifat Pertumbuhan, Genetic parameters, Ongole crossbred cattle, MC4R gene, Growth traits