Penapisan Senyawa Non Ribosomal Peptida Antibakteri Yang Dihasilkan Oleh Aktinobakteria Dari Spons Di Perairan Tulamben Bali

BAGASH PRAWIRA K, Dr. Ir. Triyanto, M.Si; Noer Kasanah, S.Si., Apt., M.Si., Ph.D.

2016 | Skripsi | S1 BUDIDAYA PERIKANAN

Adanya resistensi pada bakteri akibat pemakaian antibiotik menunjukkan perlunya senyawa antibakteri baru. Penelitian terbaru menunjukkan adanya senyawa kimia yang baru dan beragam yang dihasilkan oleh Marine Actinobacteria. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan seleksi Marine actinobacteria yang memiliki gen Non-Ribosomal Peptide Synthase (NRPS) sebagai penghasil senyawa antibakteri terhadap Aeromonas hydrophila dan Vibrio alginolyticus. Disamping itu juga untuk mendapatkan data bioaktivitas dan informasi spesies isolat Marine actinobacteria terpilih yang memiliki aktivitas antibakteri terhadap A. hydrophila dan V. alginolyticus. Penelitian ini menggunakan 10 isolat hasil penelitian sebelumnya. Parameter yang diamati yaitu gen 16S rRNA, gen nrps, dan aktivitas antibakteri dibandingkan dengan antibiotik komersil . Berdasarkan screening aktivitas antibakteri, terdapat satu isolat yang memiliki aktivitas hambat terbesar melawan A. hydrophila dan V. alginolyticus. Berdasarkan uji konsentrasi hambat, isolat terpilih mampu menghasilkan aktivitas antibakteri lebih baik dari ampisillin namun masih jauh dibawah siprofloksasin. Hasil analisis gen 16S rRNA isolat terpilih CG-1-613-7 menunjukkan bahwa isolat tersebut memiliki kesamaan dengan Nocardiopsis alba. Analisis sekuen gen nrps menunjukkan similaritas sekuen gen nrps isolat CG-1-613-7 dengan sekuen spesies Streptomyces venezuelae

The aims of this study was to select marine actinobacteria which contain Non Ribosomal Peptide Synthase gene as the producer of antibacterial compound against Aeromonas hydrophila and Vibrio alginolyticus. This study was to gain the information on the bioactivity of the selected isolate against A. hydrophila and V. alginolitycus. Ten pure isolates of actinobacteria were obtained from previous work. Detection of nrps gene and 16S rRNA actinobacteria genes were done by using PCR with degenarate primers. The bioactivity was examined using 96 well-plate format. Potential actinobacteria that have nrps gene, produce peptide and active against test bacteria were identified based on sequence analysis of 16S rRNA gene. Sequence analysis of nrps gene was done to predict similarity of compound produced. Result showed that isolate CG-1-613-7 similar to Nocardiopsis alba and potential to produce non ribosomal peptide with activity against A. hydrophila and V. alginolyticus.

Kata Kunci : A. hydrophila, antibakteri, analisis sekuen gen, marine actinobacteria, Non-Ribosomal Peptide Synthase, skrining aktivitas antibakteri, V. alginolyticus