Identifikasi Bakteri Proteolitik dan Lipolitik Menggunakan Gen 16S rRNA sebagai Penanda Genetik

WINDA TASIA, M. Saifur Rohman, S. P., M.Si., M.Eng., Ph.D.

2015 | Skripsi | S1 MIKROBIOLOGI PERTANIAN

Protease dan lipase merupakan enzim penting dalam dunia industri. Bakteri merupakan salah satu sumber protease dan lipase yang potensial. Oleh karena itu isolasi dan identifikasi secara cepat dan tepat terhadap bakteri proteolitik dan lipolitik menjadi penting dilakukan untuk mengetahui identitas bakteri secara efisien dan memudahkan pemanfaatannya lebih lanjut. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi bakteri proteolitik dan lipolitik yang diisolasi dari limbah industri susu menggunakan gen 16S rRNA sebagai penanda genetik. Seleksi bakteri proteolitik dilakukan menggunakan medium agar susu skim 1%, sedangkan seleksi bakteri lipolitik dilakukan menggunakan medium yang mengandung 1% Tween 80 dan 0,8% CaCl2. Tujuh dari 11 isolat bakteri yang berasal dari limbah industri susu dapat menghasilkan protease dan/atau lipase. Dari ketujuh isolat tersebut, hanya isolat 11A yang memiliki kemampuan ganda, yaitu sebagai bakteri proteolitik dan lipolitik. Lima isolat bakteri diantaranya dipilih untuk diidentifikasi berdasarkan urutan basa nitrogen gen 16S rRNA. Hasil identifikasi menunjukkan bahwa isolat 3A2 memiliki kedekatan dengan kelompok spesies Staphylococcus epidermidis, isolat 11A sebagai Micrococcus luteus strain 3F, isolat bakteri 12B sebagai jenis Shigella, isolat bakteri 14C sebagai jenis Acinetobacter, dan isolat bakteri 19A2 diidentifikasi sebagai Staphylococcus hominis strain 6R-J-7c.

Protease and lipase are important enzymes for industrial purposes. Those enzymes could be obtained from different kind of sources. Among them bacteria are the most promising sources for protease and lipase enzymes. Therefore, the objective of this work was to isolate and identify protease and lipase producing bacteria from dairy wastewater. Bacterial identification was carried out using 16SrRNA gene as genetic marker. The minimal media agar containing 1% skim milk was used for isolating the proteolytic bacteria, while lipolytic bacteria were selected using media containing 1% of Tween 80 and 0.8% of CaCl2. From this work, seven out of eleven bacterial isolates were known to be able to produce protease and/or lipase. Among them only isolate 11A that showed to be able to produce both protease and lipase. Five of selected isolates were subjected for further identification base on 16SrRNA gene as genetic marker. The results showed that isolate 3A2, 11A, and 19A2 were close to Staphylococcus epidermidis species group, Micrococcus luteus strain 3F, and Staphylococcus hominis strain 6R-J-7c, respectively. Isolate 12B belong to the group of Shigella and and 14C belong to Acinetobacter group.

Kata Kunci : bakteri lipolitik, bakteri proteolitik, gen 16S rRNA, limbah industri susu