Deteksi Leptospira spp. pada Ginjal Tikus di Dataran Tinggi Napu dan Bada Kabupaten Poso Propinsi Sulawesi Tengah

GUNAWAN, Prof. dr. Tri Wibawa, PhD. SpMK(K), Dr. dr. Mahardika Agus Wijayanti, DTM&H., M.Kes

2019 | Tesis | MAGISTER ILMU KEDOKTERAN TROPIS

Latar belakang : Leptospirosis merupakan penyakit zoonosis yang disebabkan oleh bakteri Leptospira. Bakteri ini dapat menginfeksi kurang lebih 160 spesies mamalia, diantaranya adalah tikus, babi, anjing, kucing, rakun, lembu, kuda dan mamalia lainnya. Reservoar utama leptospirosis adalah tikus. Data prevalensi tikus yang terinfeksi bakteri Leptospira spp. di Dataran Tinggi Napu dan Bada, Kabupaten Poso, Propinsi Sulawesi Tengah belum pernah dilaporkan. Deteksi Leptospira pada ginjal tikus menggunakan teknik PCR dengan target gen 16S rRNA dan Lipl32. Tujuan : Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi bakteri Leptospira spp. pada ginjal tikus di Dataran Tinggi Napu dan Bada Kabupaten Poso Propinsi Sulawesi Tengah Metode : Penelitian deskriptif. Subjek adalah ginjal tikus dalam larutan alkohol 70% yang diambil dari survei tikus Balai Litbangkes Donggala. Data dianalisis secara deskriptif. Hasil sekuensing dianalisis menggunakan BLAST dan analisis filogenetik dengan MEGA 6.2 software. Hasil : Leptospira patogenik terdeteksi pada tikus dengan spesies R. argentiventer dan Paruromys dominator dengan habitat di sawah dan kebun. Sekuen sampel dengan target gen LipL32 menunjukkan similaritas 99% dengan L. interrogans serovar Hardjo, Autumnalis, Lai, Icterohaemorrhagiae, Balico, Grippotyphosa, Mini, Canicola, Hebdomadis; L. noguchii serovar Pomona dan L. kirschneri. Sedangkan sekuen sampel dengan target gen 16S rRNA menunjukkan similaritas 99% dengan L. interrogans serovar Canicola, Copenhageni, Autumnalis, Pyrogenes, Javanica, Icterohaemorrhagiae, Manilae, Bratislava, Linhae, Hebdomadis dan L. kirschneri serovar Grippotyphosa. Kesimpulan : Pemeriksaan PCR Leptospira patogenik dengan target gen LipL32 dan 16S rRNA terdeteksi pada tikus dengan spesies R. argentiventer dan Paruromys dominator. Hasil analisis filogenetik dengan target gen LipL32 menunjukkan bahwa sampel ginjal yang positif Leptospira spp kekerabatannya dekat dengan L. interrogans serovar Hardjo dari Indonesia, serovar Autumnalis dari India, serovar Lai dari China, serovar Icterohaemorrhagiae dari India, serovar Balico dari Philippines, serovar Grippotyphosa dari Malaysia, serovar Mini dari India, serovar Canicola dari Iran, serovar Hebdomadis dari China; L. noguchii serovar Pomona dari China dan L. kirschneri dari USA. Dan hasil analisis filogenetik dengan target gen 16S rRNA menunjukkan bahwa sampel ginjal yang positif Leptospira spp kekerabatannya dekat dengan L. interrogans serovar Canicola dari Mesir, serovar Copenhageni dari Brasil, serovar Autumnalis dari Rusia, serovar Pyrogenes dari Rusia, serovar Javanica dari Rusia, serovar Icterohaemorrhagiae dari Brasil, serovar Manilae dari Jepang, serovar Bratislava dari USA, serovar Linhae dari China, serovar Hebdomadis dari Jerman dan L. kirschneri serovar Grippotyphosa dari Russia.

Background : Leptospirosis is a zoonotic disease caused by bacteria from the genus Leptospira. Leptospira bacteria can infect more than 160 species of mammals, such as rats, pigs, dogs, cats, raccoons, cattle, horses and other mammals. The main reservoir of leptospirosis is rats. PCR technique targeting gene 16SrRNA and LipL32 is used to detect pathogenic Leptospira bacteria in kidney tissues. Objective : This study aimed to detect Leptospira spp. bacteria in kidney tissues of rats in the Napu and Bada Highlands of Poso District, Central Sulawesi Province. Methods : This research is a descriptive analytic study. The subject was rat kidneys in 70 % alcohol solution which were obtained from survey conducted by Institute Of Health Research and Development Donggala in the Napu and Bada Highlands of Poso District, Central Sulawesi Province. Leptospira detection using the PCR method with the target gene 16S rRNA and LipL32 in kidney tissues of rats. Data were analyzed descriptively. Sequence analysis was done using BLAST, while phylogenetic tree analysis was done using MEGA 6.2 software. Results : Pathogenic Leptospira DNA was detected in rats with R. argentiventer and Paruromys dominator species from the Napu and Bada Highlands of Poso District, Central Sulawesi Province with habitat in rice fields and gardens. Sample sequences with target gene LipL32 show 99% similarity with L. interrogans serovar Hardjo, serovar Autumnalis, Lai, Icterohaemorrhagiae, Balico, Grippotyphosa, Mini, Canicola, Hebdomadis; L. noguchii serovar Pomona and L. kirschneri. Whereas the sample sequence with the target gene 16S rRNA showed 99% similarity with L. interrogans serovar Canicola, Copenhageni, Autumnalis, Pyrogenes, Javanica, Icterohaemorrhagiae, Manilae, Bratislava, Linhae, Hebdomadis and L. kirschneri serovar Grippotyphosa. Conclusion : Leptospira detection using the PCR method with the target gene 16SrRNA and LipL32 was detected in rats with R. argentiventer and Paruromys dominator species. Serovar Leptospira that infect rats with the target gene LipL32 is L. interrogans serovar Hardjo from Indonesia, serovar Autumnalis from India, serovar Lai from China, serovar Icterohaemorrhagiae from India, serovar Balico from Philippines, serovar Grippotyphosa from Malaysia, serovar Mini from India, serovar Canicola from Iran, serovar Hebdomadis from China; L. noguchii serovar Pomona from China and L. kirschneri from USA. The Leptospira serovar which infect rats with a target gene 16S rRNA is L. interrogans serovar Canicola from Egypt, serovar Copenhageni from Brasil, serovar Autumnalis from Russia, serovar Pyrogenes from Russia, serovar Javanica dari Russia, serovar Icterohaemorrhagiae from Brasil, serovar Manilae from Japan, serovar Bratislava from USA, serovar Linhae from China, serovar Hebdomadis from Germany and L. kirschneri serovar Grippotyphosa from Russia.

Kata Kunci : Leptospira, 16S rRNA, LipL32, PCR, Ginjal Tikus/Leptospira, 16S rRNA, LipL32, PCR, KidneyÃ�¢ï¿½ïÂÂ&ique