IMPLEMENTASI METODE STEREOLOGI NON BIAS UNTUK MENGHITUNG VOLUME ORGAN BERBASIS PENGOLAHAN CITRA

MOHAMMAD AMMAR FAIQ, Ir. Balza Achmad, M.Sc.E.;Dr. Ginus Partadiredja, M.Sc ,Ph.D.

2016 | Skripsi | S1 TEKNIK FISIKA

Metode stereologi non bias berdasarkan perhitungan jumlah titik (point counting) merupakan sebuah metode yang digunakan untuk menghitung nilai estimasi volume dari suatu sampel organ. Stereologi menghubungkan struktur bentuk geometri dari suatu objek tiga dimensi sehingga dapat dianalisis menggunakan bentuk geometri objek dua dimensi. Pada penelitian ini, dilakukan perancangan dan pembangunan sebuah perangkat lunak untuk dapat melakukan perhitungan nilai estimasi volume menggunakan metode stereologi non bias dengan dimensi uji titik. Dari perangkat lunak yang sudah dibangun, hasil perhitungan dari perangkat lunak akan dibandingkan dengan hasil pengukuran dengan prinsip Archimdes serta perhitungan secara manual yang telah dilakukan oleh ahli. Dari hasil perhitungan perangkat lunak, didapatkan nilai estimasi volume rata-rata dan standar deviasi sebesar 36.529,25 ± 178,12 mm^3 untuk sampel plastisin, dengan hasil pengukuran volume yaitu 30.000 mm^3. Perhitungan sampel organ ginjal pada tikus sebesar 160,07 ± 0,70 mm^3 dengan nilai perhitungan manual yang terhitung sebesar 159,23 mm^3. Sementara untuk sampel Ganglion Trigeminal pada tikus, didapatkan nilai 0,3840 ± 0,0101 mm^3 pada perhitungan perangkat lunak dengan 0,3648 mm^3 pada perhitungan manual. Disimpulkan bahwa perhitungan pada perangkat lunak sudah berhasil dibangun dengan persentase galat dibawah 25% relative terhadap pengukuran dan perhitungan manual.

Unbiased stereological method based on point counting is a method for estimating volume from tissue samples. Stereology links geometrical structure of three dimensional objects to be analyzed in two dimensional geometry. The purpose of this research is to develop a software to calculate volume estimation value from a sample of tissues based on unbiased stereological with point counting method. The calculated volume estimation value is compared with the value which is manually calculated by an expert. The mean of volume estimation value and standard deviation for plasticine is 36.529,25 ± 178,12 mm^3, with volume measurement using Arcimedian principle is 30.000 mm^3. For rat kidney volume estimation calculated by the software is 160,07 ± 0,70 mm^3 while for manually calculated is 159,23 mm^3. For rat Gangion Trigeminal sample, the mean of volume estimation value and standard deviation the software calculated is 0,3840 ± 0,0101 mm^3, and manually calculated is 0,3648 mm^3. Based on analysis, the software calculation can be used for further analysis using unbiased stereological with point counting method because the value that the software calculated between the measurement and manual calculation is not very different and still within the value of manual calculation with error percentage below 25%.

Kata Kunci : metode stereologi, prinsip Cavalieri, perhitungan volume, citra mikroskop, pengolahan citra